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鳜鱼(Siniperca chuatsi)隶属鲈形目,是我国十分名贵的淡水鱼类,其生长性状作为一种重要的经济性状,决定着生产成本和经济效益,因此,培育生长快的鳜鱼新品种已成为提高鳜鱼养殖产业发展水平的主要途径。然而,目前鳜鱼分子遗传基础研究薄弱、基因组序列信息匮乏及生长相关分子机理研究不足,都制约着鳜鱼分子标记辅助育种的开展。因此,本研究通过挑选同批生长差异较大的鳜鱼,分别提取脑和肝脏RNA,进行数字基因表达谱测序,并以实验室已有鳜鱼转录组为基础,筛选鳜鱼生长相关候选基因,从转录水平初步探讨鳜鱼生长的分子机制,为后续功能基因研究和分子标记辅助育种提供有价值信息。主要结果结论如下:1、本研究进行的数字基因表达谱(DGE)测序,对生长快鳜鱼脑(B1B)、生长快鳜鱼肝(B1L)、生长慢鳜鱼脑(S1B)和生长慢鳜鱼肝(S1L)4个组的样品进行数字基因表达谱测序,结果获得41040945个Tags,经过去杂质共得到38650216个Clean tags,所占比重为Tags总数的94.17%。每个样品获得的数据量都大于6M,说明数据量能够满足信息分析的需要。获得的数据大多数都能与转录组参考基因比对上,说明DGE测序的结果良好。2、以本实验室的鳜鱼转录组为参考,通过DGE测序共筛选出2171个差异表达基因,其中脑中的差异表达基因413个,肝中的差异表达基因1758个。对获得的差异基因进行GO富集和KEGG分析,结果表明这些差异基因大多涉及到生长轴通路、三羧酸循环通路、食欲调控通路、能量代谢通路以及生肌调控通路等。筛选得到的这些基因都与鳜鱼的生长性状密切相关,这些基因均可作为分子标记辅助育种的候选基因,为鳜鱼相关功能基因的研究及培育生长快的鳜鱼新品种奠定基础。3、对测序获得的差异基因,进行荧光定量PCR验证,以进一步检测数字基因表达谱的可靠性,及数据分析的准确性。实时荧光定量PCR结果表明,生长激素(GH)、生长抑素前体(PSS)、前脑啡肽原(Proenkephalin)、胰岛素样因子结合蛋白1(IGFBP-1)、脂蛋白脂肪酶(LPL)和葡萄糖激酶(GK)六个差异表达基因的变化情况与DGE分析的结果完全一致,说明本研究的结果可靠。本研究筛选获得的差异表达基因可作为鱼类生长相关的功能基因,为鳜鱼分子育种和基因功能研究打下坚实基础。