【摘 要】
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在群体遗传学中,基因连锁分析是发现群体遗传规律的重要方法.对于家系中的成员,患某种复杂疾病的几率受到遗传很大影响,那么如何从家系中高效地选择连锁所需的个体,即用尽可能少的样本量,来发现家系中的基因连锁关系成为生物医学领域重要研究方向.已有文献主要研究近亲亲属对极值设计,并证明其具有较高的功效,但是对于远亲亲属对的极值设计并没有具体的论述,该类问题还有进一步研究的空间.本文基于极值兄弟对设计进行了拓
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在群体遗传学中,基因连锁分析是发现群体遗传规律的重要方法.对于家系中的成员,患某种复杂疾病的几率受到遗传很大影响,那么如何从家系中高效地选择连锁所需的个体,即用尽可能少的样本量,来发现家系中的基因连锁关系成为生物医学领域重要研究方向.已有文献主要研究近亲亲属对极值设计,并证明其具有较高的功效,但是对于远亲亲属对的极值设计并没有具体的论述,该类问题还有进一步研究的空间.本文基于极值兄弟对设计进行了拓展延伸.首先对亲属对极值一致设计和极值不一致设计的检验功效和所需样本量进行理论推导,并对两种亲属对极值设计方法进行比较.结果表明,对于极值不一致设计来说,随着遗传力的增大,两种亲属对检验功效相差不多,而近亲亲属对比远亲亲属对达到1-β功效所需的样本量要小.对极值一致设计来说,随着遗传力的增大,远亲亲属对功效略高于近亲亲属对功效,且远亲亲属对达到1-β功效所需的样本量比近亲亲属对相差不多.最后,通过模拟研究验证了对于极值一致亲属对设计来说,当重组率较小时,远亲亲属对功效要高于近亲亲属对,但随着样本量的增大,二者功效差距并不明显.对于二者样本量来说,随着遗传力的增大,只有在可加遗传模型下,远亲亲属对所需样本量小于近亲亲属对所需样本量,而对于显性和隐性模型来说,近亲亲属对所需样本量要小于远亲亲属对所需要样本量.综上所述,通过本文所提出的方法将为某些家系复杂疾病连锁分析提供更多样本选择策略,从而提高其连锁检验效率并降低其时间成本.
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