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目的：高血压和高同型半胱氨酸血症（HHcy）是我国居民脑卒中发生的最重要的两个可控危险因素，本研究拟采用大样本社区调查了解中国农村高血压患者血清同型半胱氨酸（Hcy)水平以及HHcy人群患病率，并探索可能影响HHcy的主要影响因素。方法：2008.5～2009.8在安徽省安庆市和江苏省连云港市的两个农村社区原发性高血压患者，进行血压测量、问卷调查、临床检查和血清Hcy浓度及亚甲基四氢叶酸还原酶（MTHFR）基因多态性检测。HHcy的诊断标准为血Hcy>10umol/L.通过单因素和多因素相关分析筛选可能导致HHcy的重要遗传和环境因素结果：本研究共包括原发性高血压患者21373例，平均年龄60.0±7.5岁，其中男性8610例（40.3%），女性12763(59.7%)。男性Hcy几何分布为13.1±8.0umol/L，女性为10.2±4.3umol/L;HHcy的发病率男性为65.3%，女性为44.0%。在调整了年龄、性别、生活方式、基因型、血压、地域、BMI等因素后，连云港和安庆地区HHcy比例在男性无明显区别，而连云港地区女性高Hcy比例显著低于安庆地区（OR=0.86;95%CI:0.78-0.94，P=0.002）。年龄在两个性别中都和HHcy发病率呈线性增加趋势。高血压严重程度在女性中对于HHcy患病率有显著性影响（中度OR=0.86；95%CI：0.79-0.94；重度OR=0.89,95%CI0.79-0.94），在男性中却没有显著关系。抽烟和HHcy患病率在两个性别中均没有显著关系，而饮酒和HHcy患病率均呈显著负相关关系。BMI和HHcy患病率在男性和女性中都呈现显著正相关关系。MTHFR677C/T多态性和HHcy在男性和女性中都保持高度相关。TT基因型HHcy发病率显著高于其他基因型， CC型相比，男性中CT型和TT型的OR值分别为1.32（95%CI：1.19-1.47）和3.92（95%CI：3.39-4.52），在女性CT型和TT型的OR值分别为1.23（95%CI：1.12-1.35）和3.42（95%CI：3.07-3.70）。结论：中国农村社区高血压患者中HHcy发病率高，性别，年龄，和MTHFR677C/T多态性是影响HHcy患病率的重要因素。