【摘 要】
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地衣是由真菌和藻类共生的能进行有性及无性繁殖的一类植物,在世界范围内分布广泛。常生活在岩石,树皮,土壤、砖墙的表面。因其特别能适应严酷的环境,故从极地到赤道,从高山到平原,从沼泽到沙漠均有分布。据最新统计,已知中国地衣共计1766种,25亚种,244变种和233变型。本研究选取了采自于黑龙江五大连池风景区的地衣为实验材料,共19个属27个种38份材料。采用了6个基因片段,包括一个细胞色素C氧化酶亚
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地衣是由真菌和藻类共生的能进行有性及无性繁殖的一类植物,在世界范围内分布广泛。常生活在岩石,树皮,土壤、砖墙的表面。因其特别能适应严酷的环境,故从极地到赤道,从高山到平原,从沼泽到沙漠均有分布。据最新统计,已知中国地衣共计1766种,25亚种,244变种和233变型。本研究选取了采自于黑龙江五大连池风景区的地衣为实验材料,共19个属27个种38份材料。采用了6个基因片段,包括一个细胞色素C氧化酶亚基I基因(即CoI基因),两个线粒体核糖体的小亚基片段(mtSSU-rDNA/RNA),两个核基因的ITS片段(nrDNA/RNA-ITS)和一个延伸因子EF1-a。DNA条形码技术是一种新型的、强有力的物种鉴别技术。在动物中,CoI片段已经作为一种通用的DNA条形码片段;然而植物和菌物中的研究较为缓慢,尚不存在公认的DNA条形码片段,暂时处于对各种片段的比较和评价阶段。根据所选取的6个片段,通过实验分析比较了样本间的遗传距离以及Barcoding Gap的检验来测试其作为DNA条形码在地衣中的区分效果。得到的结果如下:(1)CoI采用PenF/AspR引物扩增困难,没有得到扩增结果。(2)mtSSU-rRNA只有小部分材料能扩增出来,但片段过短(约260bp),测序失败,没有得到结果;mtSSU-rDNA扩增效果较好,但片段过长(约1500bp),测序失败,也没有得到结果。(3)nrDNA-ITS,nrRNA-ITS,EF1-a三个片段在所选的所有样本中大多数都能成功扩增并测得序列,应用生物统计软件MEGA4.0构建系统进化树,分析其样本间的遗传距离。结果得出种间平均距离和种内平均距离有一定差距的是nrRNA-ITS片段,距离分别为0.600和0.030,经过DNA Barcoding Gap的检验,具有一定的间隙。研究结果表明,nrRNA-ITS的扩增效果最好,对物种的区分度最好。在地衣的DNA条形码筛选的后续研究工作中,建议把nrRNA-ITS作为地衣条形码的测试片段。
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