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本研究以取自四川雅安、龙泉和福建的52份枇杷品种(系)为研究材料,通过使用74对已开发的蔷薇科桃属EST-SSR引物,筛选出在52份枇杷种质上具有位点的多态性引物,对52份枇杷种质进行遗传多样性分析和构建其独有的分子身份证。本研究的主要结果如下：1.通过琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,结果显示74对已开发的桃属EST-SSR引物中有43对在枇杷种质上扩增出了位点,引物转移率为58%。多态性引物筛选结果显示有36对引物具有多态性。2.从已筛选出的引物中选择出多态性好、扩增条带清晰、重复率高的15对引物进行多态性分析,15对引物总共扩增出74条条带,每对引物扩增条带介于2-9之间,平均每条引物扩增4.93条条带。15对引物中,P06和P59两对引物的PIC值都大于0.5,表现出高度多态性,所选EST-SSR引物大多表现为中、高度多态。3.对52份枇杷种质聚类分析结果显示,52份材料的遗传相似系数介于0.80-0.96之间,表明所用材料具有较近的亲缘关系。在SM为0.832处,可将所有材料分为了4大类,第1类为原产地在浙江和江苏的‘软条白沙’和‘白玉’两个品种,第Ⅱ类由采自福建的‘乌躬白’和四川农业大学园艺生物技术中心的24号品系组成,第Ⅲ类包括四川农业大学园艺生物技术中心的40号枇杷品系和取自龙泉的三个枇杷种质材料(LQ42、LQ45‘龙泉1号’),第1V类则主要包括取自四川农业大学园艺生物技术中心的材料(编号LQ1-LQ23、LQ25-LQ39、‘白梨’)。4.用15对EST-SSR引物,按规定引物排列顺序、选择最小等位基因的编码赋值等原则,构建了52份枇杷种质独一无二的分子身份证。5.选择9对候选核心引物进行随机引物组合,根据不同类型的引物组合,选择出了每种类型最佳的核心引物组合。选出了由P06+P59两对引物组成的最有效的核心引物组合,这两对引物可以区分出26份种质,平均每对引物区分种质数可以达到13份。综合种质区分总数以及平均每对引物区分种质数两个指标,最终选用选择C69组合类型中的6对引物(P06、P59、P48、P46、PS07、P56)为本研究的核心引物,6对引物可以区分出46份枇杷种质,平均每对引物可以区分出7.7份种质,既保证了每对引物区分的种质数较多,又保证了引物区分种质数的总量。6.通过对不同引物组合的研究,发现30份材料具有特征引物,只需要用1对引物就可以将其区分出来,试验在9对候选核心引物已区分出49份枇杷种质的基础上,以PIC值高低继续逐一增加引物,结果显示,利用12对EST-SSR引物就可以将52份枇杷种质材料区分开来。