基因芯片分析急性心肌梗死患者外周血差异基因表达谱

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背景急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)作为冠状动脉性心脏病(Coronary heart disease,CHD)中较为严重的类型,其发病急、病死率高,对人民健康形成了严重的威胁。目前急性心肌梗死的诊断多依赖于临床表现、心电图的动态变化及血清生物标志物。如何更早的对急性心肌梗死进行诊断及预防,一直是我们研究的重要课题。而随着人类基因组计划完成和基因芯片技术的发展,许多单基因疾病的致病基因被发现,并应用到疾病的诊断与治疗当中。而AMI作为一种受多种遗传与环境因素影响的疾病,遗传学在AMI发病中的作用仍未明确。具体是哪些基因,通过何种细胞过程,有哪些通路参与了AMI过程尚未明确。本研究通过AMI的外周血RNA表达谱差异分析,来研究具体有哪些基因参与了AMI过程,为将来AMI早期基因诊断奠定基础。目的通过对AMI患者与健康患者外周血RNA进行基因芯片分析,筛选参与AMI疾病过程的表达差异基因,寻找AMI早期诊断的分子标记。方法我们应用基因芯片方法,分析了AMI病人及健康人的外周血RNA表达谱。选取2012.06-2014.08在我院住院治疗并明确诊断的急性心肌梗死患者12例与12例健康人作为对照组。提取外周血白细胞中的mRNA,反转录成cDNA.。选取其中3例AMI患者与3例对照组患者进行基因芯片检测。其它样品用于验证基因芯片结果的可信性。随机选择基因CYP4F3、IL13RA1、 USP25分别做为高表达组、表达无差异组和低表达组基因。行实时荧光定量PCR分析这些基因在不同分组中表达差异。结果基因芯片检测结果显示,559个基因在急性心肌梗死组表达异常,其中288个基因高表达,271个基因低表达(结果按照p-value≤0.05,|logFC|>1)。GO分析显示:这些差异基因归属于128个细胞组成,参与了521个生物过程和151个分子功能;KEGG分析显示:这些差异基因共参与107个基因通路。荧光定量PCR结果:基因CYP4F3在急性心肌梗死患者组表达高于对照组(1.62±0.27,p=0.006);基因USP25在急性心肌梗死患者表达低于对照组(0.56±0.07,p=0.003),基因IL13RA1在心肌梗死组表达与对照组无差异(1.11±0.35,p=0.681)。结论基因芯片分析结果可信,急性心肌梗死患者与健康对照人群外周血中RNA表达存在差异,CYP4F3与USP25可能成为急性心肌梗死诊断的基因标记。
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