苦瓜（Momordica charantia．L）是葫芦科苦瓜属一年生植物，雌花与雄花同株。苦瓜是一种重要的蔬菜，在全国广泛栽培，具有药用价值。　　 近年来，随着分子生物学技术的发展和应用，分子辅助育种被提出，它可以弥补传统育种的不足，加速育种进程及提高其准确性，而DNA分子标记辅助选择则能大大的提高选育准确性和效率。　　 本试验选用苦瓜品种为全雌性（X黑-d-d）苦瓜和强雄性泰国苦瓜为双亲杂交获得F1，F1与全雌性（X黑-d-d）苦瓜回交，回交获得BC1为实验材料，采用AFLP技术，获得了一条与苦瓜性别连锁的标记，并把该标记成功转化为SCAR标记。主要研究结果如下：　　 1、建立了适宜苦瓜AFLP分析的技术体系。　　 本试验以苦瓜为材料，通过对AFLP反应体系中酶切-连接三种方法比较，预扩增产物稀释倍数进行优化，建立了适宜苦瓜的AFLP体系，可用于苦瓜的遗传研究。　　 2、应用128对引物组合对苦瓜全雌性、强雌性和弱雌性三个基因池进行筛选，引物组合E10/M14在全雌性基因池中扩增出一条分子量为270bp的特异性条带。　　 3、将该特异性条带回收、克隆、测序，设计SCAR分子标记引物。利用该引物对已知性别的全雌单株88株，强雌单株66株，弱雌单株88株进行盲测，在供试88份全雌单株中85份能扩增出长度为270bp的特异性片段，准确率达到96.6％，在供试的66份强雌单株和88份弱雌单株中未能扩增出特异性片段，说明标记转化成功。