基因芯片检测经壳聚糖处理后变形链球菌生物膜细菌与脱落菌的基因差异

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目的:采用基因芯片技术检测经壳聚糖处理后的变形链球菌脱落菌与生物膜细菌的差异表达基因。方法:在盖玻片上形成48h变形链球菌生物膜,加入浓度约为2.5g/L,相对分子量为2000的壳聚糖溶液,作用15min,分别收集脱落的变形链球菌及生物膜细菌,分别提取RNA,逆转录为cDNA后进行基因表达谱芯片杂交。对所得数据进行分析。结果:经壳聚糖处理的变形链球菌生物膜脱落菌与生物膜细菌存在较多的差异基因。其中,参与转运功能,感受态,信号传导的基因在生物膜细菌中显著上调,介导蔗糖依赖性黏附参与生物膜形成,诱导耐酸性反应的产生;同时,参与能量代谢和转录调节的基因在生物膜细菌中显著下调。结论:壳聚糖通过影响黏附、耐酸相关基因、信号传导相关基因使生物膜细菌脱落。
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