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长蝽总科Lygaeoidea,隶属于昆虫纲Insecta半翅目Hemiptera异翅亚目Heteroptera蝽次目Pentatomorpha。广泛分布于内蒙古各地,其中大多数种类为经济害虫,可对农田、草原和森林构成较大威胁。多数种类体色暗、体型微小,形态学特征相似,物种鉴定有一定难度,分类关系存在争议。本研究首次利用DNA条形码对内蒙古长蝽总科昆虫进行分类研究,扩增长蝽总科COI基因序列96条并从GeneBank数据库中下载31条,共127条序列,隶属于6科27属39种,分析了长蝽总科COI基因序列的特征,探究了COI基因作为DNA条形码在长蝽总科昆虫物种鉴定中的适用性,采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、贝叶斯推论法(BI)讨论长蝽总科系统发育关系,并对谷子小长蝽Nysius ericae6个不同地理种群之间的遗传关系进行分析。主要研究结果如下:通过GeneBank数据库和BOLD数据库相似度比对,并与形态学鉴定相结合,发现Lamproplax picea为中国新纪录种,大盐长蝽Henestaris halophilus为内蒙古新纪录种,Emblethis vicarius和Emblethis branchynotus可能为同物异名关系。长蝽总科COI基因序列分析表明:A+T的平均含量(65.6%)明显大于G+C的平均含量(34.6%),碱基表现为明显的A+T偏向性,与大部分昆虫的碱基偏向性一致;在氨基酸组成上也存在偏向性,亮氨酸UUA(L)使用密码子的编码频率最高(11.4),半胱氨酸UGU(C)、UGC(C)密码子使用频率最低(0),在39种长蝽总科昆虫中色氨酸Trp(2.94)、组氨酸His(1.96)、半胱氨酸Cys(0)含量完全一致;碱基替换分析中,转换主要发生在T与C之间(80%),颠换主要发生在T与A之间(20%)。采用K2P模型计算COI基因序列的遗传距离,种内最大遗传距离(4.41%)小于种间最小遗传距离(6.56%),种内、种间遗传距离不存在交叉现象,平均种间遗传距离/平均种内遗传距离大于173,远超过10倍准侧;构建NJ树,同一物种均形成单系,与传统分类学结果一致;使用Species Identifier 1.0中Best match、Best close match和All species barcodes 3种方法准确鉴定成功率分别为100%、87.61%、92.03%,Cluster方法将数据序列划分为40组;jMOTU分析物种划分成功率为95.28%,41组。ABGD分析物种划分成功率为93.70%,38组。PTP分析,物种划分成功率为97.64%,40组。以上5种方法中仅基于K2P遗传距离模型构建NJ树所得到的结果与传统分类学结果一致,其他方法均与传统分类学结果有差异,表明目前运用的长蝽科分类可能存在待完善的地方。以红蝽总科中小斑红蝽Physopelta cincticollis作为外群,研究39种长蝽总科昆虫的系统发育关系,结果显示在39种长蝽中,共有7属有2个及以上物种,其中5属,均形成单系;直缘长蝽属整体嵌套在小长蝽属Nysius中,与沙地小长蝽Nysius senecionis亲缘关系最近,对此应进一步研究,以确定其分类地位。地长蝽科Rhyparochromidae中的Plinthisus lativentris在NJ、MP、BI系统发育树中的位置变化较大,分别与长蝽科Lygaeidae中桦穗长蝽Kleidocerys resedae、尖长蝽科Oxycarenidae中淡色尖长蝽Oxycarenus pallens、杆长蝽科Blissidae中高粱狭长蝽Dimorphopterus spinolae聚合,而与地长蝽科其他物种关系较远,在一定程度上支持了将全缝长蝽亚科Plinthisinae从地长蝽科Rhyparochromidae中独立出去,提升为全缝长蝽科Plinthididae的观点。COI基因序列进行长蝽总科昆虫系统发育研究时,在属级阶元系统发育树的拓扑结构基本一致,但在高级阶元的系统发育关系较为混乱,说明COI基因可以作为分析长蝽总科属间、种间系统发育关系的分子标记。谷子小长蝽Nysius ericae 6个不同地理种群(呼和浩特、通辽市、赤峰市、乌海市、锡林郭勒市、鄂尔多斯市)的遗传分析表明,总群体的Tajima’s D为-0.7780(P>0.10),Fst为0.75,基因流Nm为0.21,存在一定的遗传分化;分子方差分析(AMOVA)结果显示变异主要存在于种群之间;采集自通辽市大青沟(TL)的谷子小长蝽独享单倍型H2。