面向液态金属凝固的分子动力学并行算法研究与实现

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金属的凝固过程是一个非常复杂的过程,既包含宏观过程也包含微观过程。分子动力学可以从微观尺度对液态金属凝固的过程进行模拟。在分子动力学模拟中,模拟体系包含的粒子数越多,得到的数据就越精确,就越能精确地得到液态金属凝固过程中的微观性质,预测事物发展的趋势,对具体的生产实践提供指导。但是分子动力学串行程序运行速度慢,模拟的原子数目有限,使模拟得到的结果与真实情况差距较大。并行计算的兴起,为大规模的分子动力学并行化提供了条件,促进了分子动力学并行化的快速发展。本文对分子动力学和并行计算基本理论进行了简单的回顾,根据并行计算的基本理论与方法,把之前用于模拟液态金属凝固的分子动力学并行程序改成基于MPI+OpenMP计算模型的并行程序,论文的核心工作包括以下内容:首先,针对以前的PVM并行程序只能模拟50,000-100,000个原子和计算效率低的问题,根据天河超级计算机的特点,结合分子动力学与并行计算基础,设计基于MPI+OpenMP模型的分子动力学并行算法,其中节点之间用MPI实现并行,节点内采用OpenMP实现并行。其次,我们用FORTRAN语言实现了该并行算法,与之前的并行程序进行了对比,并分析了此程序的性能。结果表明,该算法具有良好的加速比、并行效率和可扩展性,能够模拟500,000-10,000,000个原子,使模拟规模扩大100倍。最后,我们用该并行程序对5,000,000个Al原子进行了数值模拟分析,实验结果表明,模拟结果与真实结果基本一致,并得到了真实实验与小规模模拟实验不能的得到到的微观特性,证明了改后算法的正确性。
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