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本文主要研究中国南方亚热带广东广西地区的根瘤菌,包括格木根瘤菌的多样性与进化分析,以及新结瘤基因型花生慢生根瘤菌的基因组序列分析。格木,俗称“铁木”。本文对分离自广东、广西省四个地区的166株格木根瘤菌进行了系统的研究。通过限制性酶切片段长度多态性(RFLP)分析16S-23S IGS序列,将166株根瘤菌分为22个型,表明格木根瘤菌具有很大的遗传多样性；选取各型的代表菌共23株分析它们的16SrRNA、16S-23S IGS以及持家基因recA和glnll序列,确定了它们的分类地位。格木根瘤菌都是慢生根瘤菌被分为4个种群,分别是优势种群：Bradyrhizobium elkanii和Bradyrhizobium pachyrhizi,而Bradyrhizobium yuanmingense和一个潜在的新种群Bradyrhizobium sp. I则作为次要种群。且进化动力分析结果表明基因突变和纵向遗传是格木慢生根瘤菌进化的主要推动力。结瘤基因nodC和固氮基因nifH序列的系统发育分析将格木根瘤菌分为5-6个分支,分类结果与持家基因结果较一致,表明共生基因与持家基因呈共进化关系。根瘤菌的种群分布特征与土壤理化因子相关性分析结果表明,B. elkanii的菌株偏好酸性土壤,且土壤pH(4.24-5.39)与B. elkanii的分布呈正相关,却对B. pachyrhizi的分布无显著影响；土壤中有效磷的含量(14.0-75.5)与B. pachyrhizi的分布呈负相关。用多相分类法鉴定了两个慢生根瘤菌新种群,分别命名为格木慢生根瘤菌(Bradyrhizobium erythrophlei sp. nov.)和铁木慢生根瘤菌(Bradyrhizobium ferriligni sp. nov.),模式菌株为CCBAU53325T和CCBAU51502T。本文还对广东广西新结瘤基因型花生慢生根瘤菌(CCBAU53363和CCBAU51649)进行了基因组测序和分析,定位16个常见共生基因在基因组当中的大小、位置和方向,并比较其与其他慢生根瘤菌基因组中相关基因的系统发育关系,结果表明它们与其他慢生根瘤菌共生基因的同源性都很低,从基因组水平验证了其确实具有新型共生基因。且固氮基因的同源性与光合慢生根瘤菌最高。