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本研究是在我国完成的问号钩体赖型赖株(＃56601)全基因组测序工作及ORF初步注释的基础上开展的。利用Primegens引物设计软件筛选出问号钩体赖型赖株基因的特异性区域进行引物设计。对成功设计出相应引物的基因用PCR方法进行扩增，共获得3290个产物用于点样，首次制备了问号钩端螺旋体的基因组DNA芯片。并用双色荧光杂交策略对芯片质量进行了初步评估。参考株自身杂交实验的结果表明：该芯片具有较高的点一致性、信噪比和较低的假阳性率。初步建立了相应的比较基因组学和转录组学的研究平台，利用芯片的高通量、高度自动化等特点，可大规模开展这两方面的研究工作。