间期FISH和SNP芯片技术在多发性骨髓瘤遗传学异常检测中的意义

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目的:1应用间期荧光原位杂交(interphase flurorescence in situ hybridizat-ion,I-FISH)技术和单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)芯片技术检测多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)患者染色体异常的发生情况及其与MM患者性别、年龄、分型、分期及其他实验室指标的关系,探讨其临床意义。2比较两种检测技术对MM患者染色体异常的检出率、敏感性,分析SNP芯片技术的额外检出率。方法:收集河北医科大学第三医院血液科自2013年5月31日至2014年12月31日初诊40例MM患者骨髓标本,进行CD138磁珠分选富集浆细胞后,利用I-FISH技术,采用特异性探针(包括TP53、IGH/MAF、IGH/FGFR3、IGH/CCND1、D13S319、1q21)检测40例MM患者染色体异常的发生情况,其中37例MM患者的骨髓标本同时进行SNP技术检测。结果:1 I-FISH检测结果1.1染色体异常的发生率在40例MM患者中35例出现染色体异常,总异常检出率为87.5%(35/40)。用TP53探针检测17号染色体缺失,阳性率为15%(6/40);用IGH探针检测14q32异常,阳性率为67.5%(27/40),其中IGH/MAF 2.5%(1/40)、IGH/FGFR3 10%(4/40)、IGH/CCND1 32.5%(13/40);用D13S319探针检测13号染色体缺失,阳性率为40%(16/40);1q21扩增阳性率为45%(18/40)。1.2染色体异常之间的关系TP53缺失与IGH重排呈正相关(r=0.324,P<0.05),与D13S319缺失呈正相关(r=0.372,P<0.05);其他染色体异常之间无相关性。1.3染色体异常与患者临床资料之间的关系IGH异常与性别呈正相关(r=0.339,P<0.05);IGH/FGFR3易位与白蛋白呈正相关(r=0.369,P<0.05),与血清钙离子呈负相关(r=-0.385,P<0.05);D13S319缺失与白蛋白呈正相关(r=0.289,P<0.05);1q21扩增与年龄呈负相关(r=-0.402,P<0.05);其他染色体异常与MM患者临床资料无相关性。2 SNP检测结果2.1染色体异常的检出率在37例MM患者中32例出现染色体异常,总异常检出率约为86.5%(32/37)。SNP芯片检测出的染色体异常的类型包括整条或部分染色体的缺失或扩增,其中缺失部分较常见的有1p、8p、13q、14q、22q;扩增部分较常见的有1q、2p、5、7、9、11q、15q、19、19p。2.2两种检测技术的比较在37例MM患者中,I-FISH和SNP芯片技术检测1q扩增的阳性率分别为45.9%(17/37)和48.6%(18/37),二者差异无统计学意义(P>0.05);13q缺失的阳性率分别为40.5%(15/37)和45.9%(17/37),二者差异无统计学意义(P>0.05);14号染色体异常的阳性率分别为67.6%(25/37)和37.8%(14/37),二者差异具有统计学意义(P<0.05);17p缺失的阳性率均为16.2%(6/37)。在37例MM患者中,I-FISH检测出的平均染色体异常的数目约为2个,SNP芯片检测出的数目约为7个。当I-FISH结果正常时,SNP芯片技术能检出额外60%病人的染色体畸变;当I-FISH结果异常时,SNP芯片技术能检出额外81%病人的染色体畸变。结论:1应用I-FISH技术检测MM患者最常见的染色体异常为14q32异常,其次为1号染色体扩增和13号染色体缺失。2 TP53缺失与IGH重排呈正相关(r=0.324,P<0.05),与D13S319缺失呈正相关(r=0.372,P<0.05)。3 IGH异常与性别呈正相关(r=0.339,P<0.05);IGH/FGFR3融合基因与白蛋白呈正相关(r=0.369,P<0.05),与血清钙离子呈负相关(r=-0.385,P<0.05);1q21扩增与年龄呈负相关(r=-0.402,P<0.05);D13S319缺失与白蛋白呈正相关(r=0.289,P<0.05);其他染色体异常与MM患者临床资料无相关性。4 I-FISH技术和SNP技术对MM患者染色体异常的检出率分别为87.5%和86.2%。当I-FISH结果正常时,SNP芯片技术能检出额外60%病人的染色体畸变;当I-FISH结果异常时,SNP芯片技术能检出额外81%病人的染色体畸变。5在检测MM患者染色体异常方面,SNP芯片技术较I-FISH技术能检出更多的染色体异常,是研究MM遗传学异常的重要方法。
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