东北酸菜和蜜蜂肠道中2个乳酸菌新种的分离与鉴定

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东北酸菜和蜜蜂肠道中富含大量乳酸菌,乳酸菌是酸菜发酵过程中的主要菌群,在酸菜制作中起主要作用;蜜蜂肠道菌群由特定的共生菌组成,而乳酸菌对蜜蜂的健康具有重要作用。因此了解其乳酸菌的多样性对东北酸菜的工艺制作和蜜蜂的健康都有重要意义。本文的研究主要通过phe S基因序列并结合16S r RNA基因序列对东北酸菜和蜜蜂肠道中的乳酸菌进行鉴定分析,从东北酸菜中分离出39株乳酸菌,蜜蜂肠道中分离出66株乳酸菌,共分离出105株乳酸菌。这105株乳酸菌分布于2个属,为乳杆菌属和片球菌属,分属于17个已知种和3个未知种。从酸菜中分离的已知种分别为:L.plantarum subsp.plantarum、L.xiangfangensis、L.brevis、L.koreensis、Pediococcus parvulus、L.buchneri、L.parabuchneri、L.coryniformis、L.paracasei、L.nenjiangensis,其中L.coryniformis为酸菜中的优势菌株。从蜜蜂肠道中分离出的已知种分别为:L.plantarum subsp.plantarum、L.brevis、L.apinorum、L.sakei、L.kullabergensis、L.parabuchneri、L.helsingborgensis、L.apis、L.kunkeei、Pediococcus acidilactici,蜜蜂肠道中的优势菌株为L.kunkeei。从酸菜中分离出2个未知种,为菌株395-6.2~T和1206-1~T,从蜜蜂肠道中分离出1个未知种为菌株F027-1-2。16S r RNA基因序列分析表明,菌株395-6.2~T在系统发育上与L.farciminis、L.formosensis、L.futsaii、L.crustorum、L.nuruki、L.heilongjiangensis、L.musae、L.nantensis、L.mindensis、L.kimchiensis、L.zhachilii、L.alimentarius、L.bobalius,L.kimchii和L.paralimentarius亲缘关系最近。菌株395-6.2~T与相近菌株16S r RNA基因序列相似性为95.7-99.4%,phe S基因相似性为85.0-94.0%,rpo A基因相似性为94.2-98.0%。菌株395-6.2~T与模式菌株之间的ANI和d DDH值分别为77.9-87.1%和22.5-33.5%。表明菌株395-6.2~T为一个乳酸菌新种。菌株1206-1~T和F027-1-2在系统发育上与L.sharpeae、L.hulanensis、L.songhuajiangensis、L.pantheris、L.thailandensis、L.camelliae、L.jixianensis、L.nasuensis、L.baoqingensis、L.manihotivorans、L.porcinae、L.brantae和L.saniviri亲缘关系最近。菌株1206-1~T和F027-1-2与相近菌株16S r RNA基因序列相似性为94.2-96.4%,phe S基因相似性69.5-83.3%,rpo A基因相似性为73.1-90.3%。菌株1206-1~T和F027-1-2经MEGAX比对,序列一致,且在NCBI上进行Blast,16S r RNA,phe S和rpo A基因相似性相同,且系统发育位置一致。16S r RNA基因序列相似性小于96.4%,表明菌株1206-1~T和F027-1-2是同一个乳酸菌新种。对新种395-6.2~T和1206-1~T(F027-1-2)进行分类学鉴定。本研究表明了东北酸菜和蜜蜂肠道中乳酸菌有一定的多样性,且分离出的乳酸菌新种扩大了乳酸菌的分类体系,为东北酸菜乳酸菌的应用和蜜蜂的健康研究以及乳酸菌资源开发提供了新的资源和思路。
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