种质遗传基础狭窄是我国玉米(Zea mays L.)育种的主要限制因素。解决这个问题的根本途径是对国内外种质资源进行系统的分类整理,有针对性地进行种质扩增和改良利用研究。目前,国内玉米种质改良侧重于二环选系,但对遗传基础丰富的地方品种和群体材料缺乏系统研究,从而限制了种质扩增和改良利用的研究范围。我国生态条件复杂,在尚未普及杂交种的地区,至今仍保存着丰富的地方种质资源有待开发利用。本文首先对两个CIMMYT的优良群体采用SSR分子标记技术探讨了关于群体遗传多样性研究的取样策略,在此基础上用70对引物对我国的44个玉米地方品种进行遗传多样性分析。主要研究结果如下: (1)设计单株取样和4种混合取样方法,采用17对SSR引物对CIMMYT的两个群体Pob69和Pobb70进行遗传多样性分析,确定研究群体遗传多样性的取样方法。通过两个群体的单株和4种混合取样方法所扩增的等位基因数目差别及它们的相关程度,得出用10个单株的混和样本来代替同样数目的单株进行群体遗传多样性分析是可行的。 (2)70对SSR引物在44个地方品种的176个样本中扩增出292条等位基因,每对引物检测出的等位基因数目为2-8条,平均每个位点4.2条。44个地方品种间的遗传相似系数在0.617-0.863之间。 (3)对44份地方品种的聚类结果为:河南省的6个品种都聚在一个类群;广西的15个品种有11个聚在一个类群,金皇后单独聚为一群,另外三个品种新圩黄、雪玉米、白马牙与山东的小粒红距离比较近,陕西的4个品种完全分散开来:山东的9个品种有5个聚在一起,大头玉米、大粒红及两个小粒红分散开,吉林的10个品种有6个聚在一起,金顶子、灯笼红、白头霜、小穗黄则穿插在山东和陕西的品种之中。 (4)在292条等位基因中,随机抽取25-292个等位基因共7个处理水平,分别对它们的遗传相似系数矩阵进行相关分析,得出下述结论:应用200条左右的等位基因就足以对本试验的44个地方品种进行有效的类群划分。 (5)在每个省的地方品种内都有特异引物在不同的品种内扩增出特异条带,这些地方品种(除广西的白马牙)都聚在各自省份的大部分品种所在的类群当中。检测出特异等位基因的这些标记包括一些从基因内部发掘的标记,综合分析44份地方品种的聚类结果,可以初步认为具有特异等位基因的这些品种有可能在一定程度上代表该省地方品种的分子指纹特征。