本研究于2018年至2019年在山东农业大学园艺科学与工程学院、国家苹果工程技术研究中心、作物生物学国家重点实验室和山东省莱州市沙河镇湾头村进行。试验以红露/M9-T337为试材,两年生苗在三种规格(10cm×30cm、20cm×30cm、30cm×30cm)黑色塑料容器中育成,2019年3月将幼苗与基质一并定植,2019年9月采样测定,分析研究了容器育苗对防控苹果连作障碍的效果。结果如下:1、容器苗幼树生长状况良好。与对照(裸根苗)相比,再植容器苗幼树的株高、地径、鲜质量和干质量以及根系构型参数(根长、根表面积、根体积)均显著增加,并均表现为30cm×30cm规格容器苗处理>20cm×30cm规格容器苗处理>10cm×30cm规格容器苗处理,其中30cm×30cm规格容器苗处理与裸根苗对照相比其株高、地径、鲜质量和干质量以及根长、根表面积、根体积分别提高了210.28%、52.49%、189.59%、171.77%、148.53%、143.59%、168.26%。2、容器苗提高了根系抗氧化酶活性,优化了光合指标。与对照相比,各规格容器苗处理的根系抗氧化酶活性和光合相关参数均有不同程度的提升,其中30cm×30cm规格容器苗处理的SOD、POD、CAT活性分别提高了90.34%、53.92%、60.38%,根系MDA含量下降了45.59%,其净光合速率(Pn)和气孔导度(Gs)分别提高了114.05%和155.88%。3、容器苗的主要土壤酶活性提高,酚酸类物质含量降低。与对照相比,各规格容器苗处理均提高了主要土壤酶活性,酚酸类物质含量降低。30cm×30cm规格容器苗处理的土壤酶活性升高程度最为显著,其脲酶、蔗糖酶、磷酸酶、过氧化氢酶活性分别提高了132.83%、64.87%、63.04%、101.97%,其根皮苷、根皮素、阿魏酸、苯甲酸、香兰素、儿茶素含量分别下降了35.79%、52.25%、50.62%、41.76%、37.93%、38.14%。4、容器苗优化了幼树根系环境微生物群落结构。与对照相比,各规格容器苗处理的的细菌/真菌值均显著增加,其中30cm×30cm规格容器苗的增加幅度最大,实时荧光定量技术(Real-time PCR)进行定量分析发现,30cm×30cm规格容器苗处理的尖孢镰孢菌、串珠镰孢菌、层出镰孢菌和腐皮镰孢菌的基因拷贝数比对照分别下降了56.42%、74.51%、93.83%、74.63%;T-RFLP图谱的主成分分析(PCA)结果表明,30cm×30cm规格容器苗处理的真菌群落结构距离裸根苗对照最远。