自主创新是促进产业结构调整和推动经济社会发展的主要动力。自主创新和产业结构优化升级之间的关系相对复杂,本文以通过自主创新促进我国产业结构优化升级为研究目标,分析了自主创新与产业结构优化升级的关系,研究了影响自主创新的各种因素,考察了自主创新对产业结构优化升级的影响途径和内在机制,并对相关问题进行了经验分析,据此提出了一些有针对性的政策建议。本文首先从自主创新与产业结构优化升级的相关理论分析入手,通过文献研究,找出了自主创新与产业结构优化升级之间可能存在的联系,指出自主创新产生的技术进步是促进产业结构优化升级的主要力量。自主创新通过对产业结构优化升级产生直接影响和间接影响,改变了三次产业在国民经济中的地位。其次,本文全面分析了影响自主创新的因素,并使用了面板数据的计量经济学分析方法,结果发现,如果以发明专利申请量作为衡量自主创新能力的指标,那么,研发经费支出、科研人员数量、基础设施等是影响自主创新的主要因素。在此基础上,提出了一些有针对性的建议,即要发挥政府在自主创新中的主导作用和企业的主体作用、高校和科研机构的引领作用,共同建设产学研一体化的自主创新体系,提高我国的自主创新能力。接着,本文对我国产业结构的现状和问题进行了分析,研究了自主创新对我国产业结构优化升级的影响途径,认为自主创新使我国三次产业结构之间的比例更加合理,也促进了三次产业内部结构的高级化。通过理论分析和经验分析,分别研究了自主创新对农业、工业和服务业内部产业结构的优化升级途径,并以高技术产业份额为代理变量,重点分析了自主创新通过促进高技术产业的发展、推动信息化和新型工业化,实现了工业产业结构的优化升级。最后,本文进一步考察了自主创新促进产业结构优化升级的内在机制,通过使用高技术产业利润和高技术产业份额作为代理变量进行了经验分析,发现自主创新一方面提高了劳动生产率,影响了产业相对成本的变动,并通过投资效应,促进生产要素在不同产业之间的流动,推动了产业结构的优化升级,即自主创新对产业结构优化升级的推动机制;另一方面自主创新不断产生新技术和新产品,改变了需求结构,拉动了产业结构优化升级,即自主创新对产业结构优化升级的拉动机制。此外,研究还发现公路等基础设施对提高自主创新能力和促进产业结构优化升级有较大的影响。为此,需要优化科研资源配置,重视需求结构调整,促进生产要素自由流动,加强基础设施建设等,充分发挥自主创新对产业结构优化升级的推动作用与拉动作用。本文通过定量与定性相结合的研究方法,在理论方面部分解决了自主创新与产业结构优化升级之间的内在逻辑关系问题。如首先从自主创新活动的不同参与者的角度出发,提出了促进自主创新的政策建议。然后以高技术产业份额作为代理变量,阐述了自主创新对产业结构优化升级的影响途径。接着从劳动生产率变动和需求变动这两个角度,将自主创新与产业结构优化升级的内在机制分为推动机制与拉动机制。本文对提出的理论观点逐一进行了实证检验,对使用的各种变量进行了度量,并尽可能使用不同的设定与估计方法进行参数估计,最后的计量分析结果也基本支持我们的预期,表明理论分析提出的假设是较为可信的,这为进一步研究自主创新与产业结构优化升级的关系提供了基础。