南极乔治王岛陆地和潮间带放线菌多样性研究

来源 :中国海洋大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Coolbear
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
南极乔治王岛位于南极洲的低纬地区,因处在南极半岛与南美大陆间的多气旋地带,具有复杂多变的气候环境特征,生态环境和生物群落对区域性或全球性气候环境变化具有敏感性,是研究南极陆地和近岸海域生态系统的理想场所。作为微生物的一大类群,南极环境中的放线菌在长期适应这一特殊地理环境的过程中,可能会形成独特的适应模式以及分子调节机制,从而产生物种的新颖性和多样性,其所蕴含的应用潜力巨大,受到国内外微生物研究学者的高度重视。本文利用PCR-DGGE技术、16S rDNA克隆文库技术和纯培养技术对南极乔治王岛陆地土壤和潮间带底泥放线菌的多样性进行了研究,为有效开发利用特有南极放线菌资源奠定基础。首先利用PCR-DGGE技术对南极乔治王岛陆地土壤和潮间带底泥共12个样品中放线菌的多样性和群落结构组成进行初步研究。从DGGE图谱中条带的多少及条带测序结果可以看出南极乔治王岛陆地土壤和潮间带底泥中蕴含丰富的放线菌资源,其中陆地土壤样品中放线菌的多样性要高于潮间带底泥样品中放线菌的多样性。测序结果显示,陆地土壤样品中的30个条带分布于放线菌纲(Actinobacteria)、酸微菌纲(Acidimicrobiia)和红椿杆菌纲(Coriobacteriia)3个纲中的10个目、15个科中,其中放线菌纲中的假诺卡氏菌科(Pseudonocardiaceae)的条带数最多,是该区域的优势菌群;潮间带底泥样品中的14个条带分布于放线菌纲和酸微菌纲2个纲中的5个目、5个科中,放线菌纲中的去甲基醌菌科(Demequinaceae)数量最多,为优势菌群。构建了4个放线菌16S rDNA克隆文库,对这12个样品中放线菌的多样性及群落结构做进一步分析。16S rDNA序列的测序结果表明,南极乔治王岛陆地土壤和潮间带底泥环境中蕴涵着丰富且多样的放线菌资源,而且陆地土壤中放线菌的多样性要高于潮间带底泥中放线菌的多样性。两个陆地土壤样品的16SrDNA克隆文库陆2和陆4中获得的放线菌均分布于放线菌纲和酸微菌纲的10个目、16个科中,这6个陆地土壤样品中共包含了10个目、19个科,其中放线菌纲占优势;潮间带底泥样品的2个16S rDNA克隆文库中放线菌的多样性相对较低,分布于放线菌纲和酸微菌纲的8个目、14个科中,其中E5和E8混合样品中获得的放线菌分布于5个目、8个科中;E1、E11、W3和W4混合样品中的放线菌分布于7个目、13个科中,这2个文库中均是酸微菌纲占优势。将不同分类单元的代表序列与最大已知同源性序列构建N-J系统发育进化树,发现很多序列形成独立的分支,与已知的同源性最大的菌株序列遗传距离较远,表明南极乔治王岛陆地和潮间带环境中蕴藏着大量的放线菌新类群。利用11种不同的培养基对南极乔治王岛陆地土壤和潮间带底泥共30个样品进行放线菌的分离纯化,共分离得到234株放线菌,经过表观排重后选取代表菌株进行16S rDNA全长序列测定并进行Blast比对,结果显示这些菌株分别属于放线菌纲的5个目,共9个属25个不同的种,以Streptomyces、 Arthrobacter和Nocardiopsis属菌株居多,其余均为稀有菌属:Tsukamurella、 Nesterenkonia、Pseudonocardia、Microbacterium、Kocuria和Mircrococcus,其中从陆地士壤17个样品中分离得到的143株放线菌属于放线菌纲的7个属、17个种;潮间带底泥13个样品中分离得到的91株放线菌属于放线菌纲的5个属、10个种。纯培养结果再次表明南极乔治王岛陆地和潮间带环境中蕴藏着丰富的放线菌资源,陆地土壤中放线菌的多样性要高于潮间带底泥中放线菌的多样性。
其他文献
针对测量值误差函数符合污染分布的情况,利用M估计的抗差特性估计未知参数,并计算各传感器污染分布统计特性,应用其分配权值进行融合.通过仿真分析证明,该法在模型及算法选择
自然拼读法和国际音标在小学英语教学中的利弊、结合的必然性,以及如何进行有效结合。
编组去向是车流组织过程中的一个重要概念,其本质特征是充当车流集结的基本单元,通过梳理车流、规范列流,实现车流向列流转变.通过对编组去向的角色分析,实现了车流向列流的
以美国武器系统效能工业咨询委员会(WSEIAC)提出的模型为基本框架,在分析了防空导弹武器系统的作战性能指标的基础上,着重研究了对抗条件下的防空导弹武器系统的作战性能。采用了
铁路智能运输系统建设将成为整合铁路信息资源,实现智能化运输控制的发展方向。铁路运力资源保障体系由于其业务数据量巨大,需要在满足列车智能控制、安全运行的前提下,满足铁路车辆、机务、工务、电务、供电,以及车务等各个业务部门信息的需求量问题。采用企业架构的理念,提出铁路运力保障体系的架构方案,对铁路运力资源保障信息系统进行集成整合,为构建铁路智能运输系统中运力资源保障体系提供有效参考。
论文首先介绍了钢管混凝土结构的特点以及钢管混凝土桁架拱桥的发展历程和结构形式。针对跨度228m公路中承式钢管混凝土桁架拱桥,概述桥梁总体设计方案和主要构件的设计参数,利用Midas/Civil建立基于梁单元的全桥有限元模型,钢管混凝土桁架拱杆件采用联合截面模拟,吊杆采用桁架单元模拟,桥面板采用梁单元模拟。模拟钢管混凝土桁架施工过程,计算分析各施工阶段桥梁各构件的变形、内力和应力。考虑恒载、活载、风
目的:帕金森病(Parkinson’s disease,PD),又称震颤麻痹,是一种常见的老年神经系统变性疾病,严重影响患者的身心健康。随着全球老龄化进程的加速,PD发病率逐年升高。PD主要病
目的:通过检测腰椎退变肥厚黄韧带组织中的细胞凋亡率及凋亡因子Caspase-3、Fas、P53的表达,为深入了解参与腰椎黄韧带细胞凋亡的信号传导途径做基础。方法:实验组取自腰椎管狭窄症行手术减压的患者50例,所有黄韧带经过术前MRI测量及术后测量证实为属于退变肥厚黄韧带组织,其中男性22例,女性28例,年龄32-74岁,平均为54.46岁。对照组取自腰椎间盘突出症及爆裂性腰椎骨折行手术减压的患者3