干扰素刺激基因IFI16和PFKFB3在宿主抗病毒免疫中的功能及机制研究

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gzh0791
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
病毒感染严重威胁人类的健康和生命安全。病毒入侵机体,诱发了宿主的抗病毒免疫反应。宿主细胞对病毒的识别及识别病原体成分后的免疫反应是宿主抗病毒免疫中的两个关键步骤。其中,γ干扰素诱导蛋白IFI16是一种独特的核酸识别受体,既可以帮助机体识别定位于胞核的病毒DNA,也可以识别定位于胞质的病毒DNA,继而参与宿主抗病毒免疫应答和炎症反应。IFI16至少有四种剪接异构体,分别为IFI16-iso1,2,3,4,其中以IFI16-iso2的结构和功能的研究较为清楚。IFI16-iso2主要定位于细胞核,识别核内复制的病毒DNA,如HSV-1,而对于胞浆复制的病毒DNA的识别,如VACV,IFI16-iso2亦可发生乙酰化,继而转运至胞浆进行有效识别。研究显示,IFI16-iso2的N端pyrin结构域主要介导分子间相互作用以及IFI16低聚物的协同组装,C端的两个HIN200结构域,可直接结合病毒DNA。我们的研究发现IFI16-isol编码的氨基酸序列长度与IFI16-iso2完全一致,但是在其N端的区域缺少了 NLS编码序列,在C端的两个HIN200结构域之间以额外的序列代替。目前关于IFI16-iso1对病毒DNA的识别及其在抗病毒免疫中的作用尚未报道。此外,病毒核酸被宿主细胞模式识别受体识别后,以IFN-I依赖或非依赖的方式触发宿主细胞抗病毒免疫信号,从而抵抗病毒入侵。有研究发现,固有免疫系统的活化需要消耗大量的生物大分子及代谢中间产物。细胞代谢的方式参与了免疫细胞的增殖、分化以及活化等,例如葡萄糖和丝氨酸的代谢,胆固醇和色氨酸的合成。其中,有文献报道,病毒感染的细胞和活化的免疫细胞均倾向于糖酵解的方式供能,因此,选择性靶向细胞的糖酵解途径将是宿主抵抗病毒感染的有效策略。一方面,为了研究IFI16-iso1在病毒DNA的识别和抗病毒免疫反应中的作用及其与IFI16-iso2的功能差异,我们采用了新型的病毒DNA模拟物及两种不同亚细胞定位的活病毒进行分析。首先,通过免疫荧光分析了外源过表达的IFI16-iso1和IFI16-iso2在细胞内的定位。紧接着,我们应用商品化的病毒DNA模拟物来进行分析,但是由于目前商品化的病毒DNA模拟物若利用常规的转染技术只能进入细胞质,不利于核内DNA受体信号的活化,因此我们对其核酸序列进行改造,并对改造前后的模拟物进行分析。在此基础上,利用改造前后的病毒DNA模拟物以及不同胞内复制的DNA病毒来分析IFI16-iso1和IFI16-iso2在病毒DNA的识别和抗病毒免疫中的差异。此外,通过RT-qPCR和Western blot初步分析IFI16-iso1和IFI16-iso2对DNA病毒诱导的免疫反应的差异。最后,采用TCID50检测过表达IFI16-iso1或IFI16-iso2的细胞上清中病毒的含量,以评估二者抗病毒能力的差异。另一方面,为了研究细胞糖酵解代谢对宿主抗病毒免疫的影响,我们从体内外多个层面进行了分析。首先,通过转录组测序分析了寨卡病毒感染或流感病毒感染的病人PBMC细胞的差异表达基因,发现糖酵解的关键限速酶PFKFB3显著被上调;紧接着,通过RT-qPCR、Western blot和荧光素酶报告基因系统检测了多种病毒刺激后PFKFB3的表达以及可能调控PFKFB3表达的上游信号分子,揭示其可能作为ISG参与宿主的抗病毒免疫反应。紧接着,采用瞬时过表达或稳定高表达的细胞系分析PFKFB3在体外的抗病毒作用;同时,采用PFKFB3小分子抑制剂3PO或应用Cre-Loxp系统构建髓系细胞特异性的Pfkfb3-/-小鼠,RT-qPCR和TCID50检测不同病毒感染后,小鼠的脏器、血清及肺泡灌洗液中病毒的含量;HE染色观察病毒感染后小鼠的组织损伤程度及炎症浸润情况;监测小鼠的生存状况等以综合评估PFKFB3在体内的抗病毒作用。收集PFKFB3及其酶活性突变质粒过表达后的细胞培养上清,即条件培养基,通过流式细胞术、RT-qPCR和TCID50检测感染前后细胞内及细胞培养上清中病毒的含量。质谱技术分析PFKFB3条件培养基中的氨基酸的含量;在此基础上,通过RT-qPCR和Western blot检测氨基酸代谢相关酶如ARG1和NOS2的变化。构建相应的截短体质粒,结合免疫共沉淀、免疫荧光及PLA临近结合技术分析蛋白之间的互作关系;应用真核及原核表达体系,纯化得到带有Flag或GST标记的PFKFB3蛋白、STAT1蛋白、STAT6蛋白以及相应的截短体蛋白,并结合Western blot检测体外反应体系中蛋白的活化情况以探究PFKFB3发挥抗病毒作用的具体的作用机制。本研究中,首先我们发现了 IFI16-iso1具有与IFI16-iso2相同数量的氨基酸,但是缺乏NLS的氨基酸序列,并且IFI16-iso1主要定位于细胞质内。其次,为了进一步区分IFI16-iso1和IFI16-iso2的功能,我们开发了新的核内病毒DNA模拟物,即合成的6个碱基的核苷酸基序(5’-AGTGTT-3’)可以有效地将原有的商品化的病毒DNA模拟物从细胞质带入细胞核内,并且被核内受体有效地识别,如IFI16-iso2和hnRNPA2B1,进而促进细胞内IFN-β及抗病毒ISGs的表达。在此基础上,我们发现IFI16-iso1和IFI16-iso2的亚细胞定位不同导致二者在病毒DNA的识别及诱导的抗病毒免疫反应的差异显著,即IFI1 6-iso1偏好与细胞质内复制的DNA病毒如VACV,及胞质病毒DNA模拟物如HSV60mer,在细胞质内发生共定位,而IFI16-iso2则更偏好与细胞核内复制的DNA病毒如HSV-1,及核内病毒DNA模拟物如HSV60-DNLS发生共定位。相较于IFI16-iso2,IFI16-iso1在识别HSV60mer或VACV后,更显著地诱导的IFN-β以ISG的转录,表现为更有效地抗病毒免疫反应。由于核质穿梭的能力,IFI16-iso2除了清除HSV-1,也能有效抵抗VACV的入侵。但是,在HSV60-DNLS或HSV-1刺激后,IFI16-iso2介导的IFN-I依赖的抗病毒免疫显著强于IFI16-iso1诱导的免疫反应。最后,我们发现PFKFB3能被多种病毒及模拟物诱导表达,提示其可能作为ISG参与了宿主的抗病毒免疫反应。功能实验表明体外过表达PFKFB3能显著抑制多种病毒在细胞内的复制;小鼠体内实验也显示髓系细胞中Pfkfb3的特异性缺失或药物抑制PFKFB3的酶活性后促进了脏器、血及肺泡灌洗液中病毒的复制,加重了组织损伤,最终导致小鼠生存率显著降低,表明PFKFB3在体内外均发挥显著的抗病毒活性。同时,我们发现PFKFB3的条件培养基也表现显著的抗病毒活性,并且不依赖IFN-I信号。氨基酸代谢质谱的结果显示PFKFB3条件培养基中了精氨酸的含量显著降低;但是在病毒感染的Pfkfb3髓系细胞特异性敲除小鼠的肺泡灌洗液以及BMDM细胞上清中,精氨酸的含量却明显增加,表明PFKFB3通过下调精氨酸的含量从而抵抗病毒入侵。机制的实验结果显示,PFKFB3的激酶结构域可以直接结合并活化STAT1和STAT6,进而促进精氨酸代谢酶Arginase1和iNOS的表达,最终消耗了精氨酸,发挥显著的抗病毒活性。总的来讲,本研究开发了一种新的核内DNA受体激动剂;发现了 IFI16-iso1在病毒DNA的识别和抗病毒免疫中的作用;此外结合病毒DNA模拟物及相应的病毒,证明了IFI16-iso1和IFI16-iso2在宿主抗病毒免疫中扮演着不同的角色;最后,我们发现了 PFKFB3基因本身及其条件培养基均具有明显的抗病毒活性,并且通过了 PFKFB3的激酶结构域与STAT1或STAT6直接相互作用,活化,进而促进下游基因的表达,调控精氨酸的消耗,最终抵抗病毒感染。
其他文献
关注当前城市发展过程中人口老龄化和既有住区公共空间适老化设计缺失之间的矛盾问题,通过分析既有住区公共空间的现状、老年人行为特征以及基于上述特征的以保护城市肌理、历史底蕴和人文关怀为核心的可持续适老化更新设计等相关内容,探讨既有住区公共空间可持续性的适老化更新模式。
随着风电机组装机容量的不断攀升,同时带来并网发电率低、机组故障率高等缺点,导致风电机组整体利用率较低。为此提出一种基于数据融合的风电变桨系统故障预警方法。首先结合SCADA系统中的运行统计信息和历史数据,采用Relief特征参数选择方法筛选出与风电变桨系统故障相关的特征参数;然后采用数据融合的方法,建立基于MSET技术的风电变桨系统故障预测模型,并采用滑动窗口法进行故障预警阈值的确定;最后以上海某
目的 构建2型糖尿病患者参与健康照护方案,为2型糖尿病患者参与健康照护提供参考。方法 2021年8月—2022年2月,通过文献研究、质性访谈、2轮德尔菲专家咨询构建2型糖尿病患者参与健康照护方案。结果 2轮咨询专家积极系数均值为97.62%,权威程度系数为0.921,最终构建的方案包括住院与居家期间2个时间段,住院期间包括3个一级条目、20个二级条目、54个三级条目;居家期间包括3个一级条目、10
<正>财政是国家治理的基础和重要支柱,国库是财政部门的有机组成部分,在国家“加快建立现代财政制度”的财政体制改革目标下,加快建立现代国库制度也被相应地赋予了新的使命和要求。本文从分析加快建立现代国库制度的必要性和必然性入手,思考现代国库制度如何促进构建新发展格局、能否促进实现共同富裕目标、怎样协调好财政与金融的关系、如何为国家参与全球治理服务的问题,
期刊
《大智度论》是相传为龙树所作、诠释《大品般若经》的著名大乘佛教论典,堪称《小品系般若经》及《大品系般若经》最早的及规模化的一部注疏著作,在大乘佛教思想史上也向来有"百科全书"的美誉。本文根据《大智度论》末卷阐释般若、方便二种菩萨道辩证关系的疏文,揭显此论在般若经诠释及大乘佛教教法思想建构方面的特殊重大贡献。
<正>疫情期间,有如此多的人远程工作,避免去健身房锻炼,居家消遣吃零食,减肥努力几乎化为泡影。如果你想在春天来临前恢复原本苗条的身材,增加一些有氧锻炼以及健康的饮食是至关重要的。食用以下19种燃脂食物能最大化瘦身效果。牛油果虽然1个中等大小的牛油果含有约15克脂肪,但不要被这个数字吓倒。除了抗氧化剂、铜、镁、锰、烟酸和核黄素,牛油果还富含健康的脂肪,这种脂肪有益于心脏健康,并加快身体脂肪燃烧的速度
期刊
目的 调查湖北省2个不同经济类型地区肺结核患者经济负担,并开展结核病防治工作的社会效果与成本效益分析,为进一步完善卫生资源投入与使用提供理论依据。方法 收集湖北省《“十三五”终期评估》的评估报告,对2020年湖北省石首市和巴东县结核病防治工作的成本-效益进行分析。采用现场调查方式调查患者的经济负担情况,并采用秩和检验进行资料分析。结果 巴东县和石首市肺结核患者总直接医疗费用中位数分别为13624(
数学学习是学生形成理性思维与科学精神的主要途径.教育部颁布的中职数学教育新课标要求,在课堂教学中应实现立德树人,聚焦于核心素养,让学生通过对数学知识的掌握和运用,逐步形成正确的价值理念以及专业技能.教师是知识的传递者,在数学课堂上,应认真分析学情及教学内容,从学生的困惑、兴趣出发,使学生感受到数学的实用价值.指数函数与对数函数是中职数学中的重要内容,同样又是课程中的重难点部分.基于此,本文以“指数