高保真DNA聚合酶分子开关用于TP53基因热点突变的检测

来源 :苏州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:x28221181
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:利用硫化修饰的碱基特异性引物偶联高保真酶所构成的突变敏感性分子“开/关”系统检测TP53基因的热点突变(G175A,G245A,C248T,G249T,G273A和C282T)。同时结合实时荧光定量PCR技术,通过扩增曲线和熔解曲线准确、快速地判断6个热点突变的存在与否,并对突变进行半定量分析。方法:将包含上述六个密码子的PCR产物克隆至pMD19-T载体,并转化至DH5α感受态细胞,通过LB/Amp/IPTG/X-gal平板筛选出白色克隆,利用载体通用引物和PCR引物对其进行菌液PCR初步鉴定,并通过测序分析进行确证,得到TP53基因的野生模板质粒。采用重叠延伸PCR技术,对所需位置的碱基进行定点突变,分别得到6种突变基因型PCR产物,克隆并用同样方法筛选出阳性克隆,经测序确证得到分别含有TP53基因G175A,G245A,C248T,G249T,G273A和C282T的突变质粒模板。然后以这六个突变位点为检测靶点,分别设计3’末端与野生型基因位点或突变型基因位点配对的硫化修饰引物;利用高保真DNA聚合酶接到突变敏感性分子开关,对TP53基因野生型质粒模板和6种突变型质粒模板进行检测,并通过凝胶成像系统进行分析;采集正常人以及肿瘤患者的组织或血样标本,通过临床样本对检测方法进行评估,并对肿瘤样本进行TP53基因6个热点突变的筛查。结合荧光定量PCR技术,评估高保真酶介导的敏感性分子开关在荧光定量PCR中的敏感性和相关性。结果:通过在不同的反应体系中分别对六个热点突变进行检测。结果显示,在高保真DNA聚合酶介导的PCR反应体系中,仅完全配对引物得以延伸,不完全配对引物则不被延伸,即3’端硫化修饰突变检测引物仅对配对的突变模板有扩增产物,对野生模板无扩增产物。运用该检测方法对20例临床健康志愿者和29例癌症患者的组织及血样做检测,未发现TP53基因的G175A,G245A,C248T,G249T,G273A和C282T突变,检测结果与测序结果一致。由此可以看出,突变敏感分子开关对体细胞突变的检测具有很好的特异性及敏感性。结论:本研究充分利用高保真DNA聚合酶偶联硫化引物构成的突变敏感性分子开关成功开发出了可准确检出TP53基因175,245,248,249,273和282号密码子单碱基突变的新方法,并通过对不同类型的临床标本的检测,验证了其高敏感性和高效性。该技术除可用于检测血液基因组DNA的遗传性突变外,还可以检测血中游离DNA中存在的微量体细胞基因突变。该技术在TP53基因筛查中具有较大的潜在应用价值,能够对含有上述TP53基因的六个突变位点的某一具体癌症进行癌前诊断,产前诊断,预防和预后检测。
其他文献
在高层建筑中,考虑到工程的安全性和适用性,经常会使用桩基础,钻孔灌注桩便是其中的一种桩基础,另外考虑到工程的经济性和稳定性,水泥粉煤灰碎石桩复合地基(以下简称CFG桩)也会
电力系统仿真是研究电力系统特征和电力控制技术的主要手段。为深入研究特高压直流输电技术和特高压交直流混联系统的特性,基于实时数字仿真器RTDS和南瑞继保自主研发制造的
目的:对比研究冠心病心肌缺血治疗中替格瑞洛与氯吡格雷的临床疗效。方法:此次68例研究对象均为笔者所在医院2018年1月-2019年2月收治的冠心病心肌缺血患者,按照双模拟法1∶1
创建现代化文明监狱不仅是必要的,而且具有可行性。创建现代化文明监狱是一项系统工程,必须正确处理好五个方面的关系。我国监狱法律制度有待进一步完备;创建现代化文明监狱的标
心理学研究表明,模仿是一种心理现象,是人类尤其是儿童的天性。作文是一种技能,客观存在着某种规律。"仿写"作为作文教学的一种手段,符合小学教育直观性原则,也符合小学生的
企业的良好运行和可持续发展离不开有效的内部控制,而存在严重缺陷的内部控制则可能导致企业破产。内部控制是审计师初步评价企业的重要内容,其是否存在重大缺陷与审计风险和
[目的]就目前而言,找到一个合适的标准用于绝经前后诸证的中医辨证分型。[方法]通过查阅近10年的关于此病中医辨证分型的文献,概括各位学者研究此病的辩证分型的情况,综合分
本文使用中国大陆287个地级及以上城市2000~2008年的面板数据,检验了中国城市的产业集聚对劳动生产率的影响。研究发现,产业集聚带来的拥塞效应和集聚效应在不同时期可能处于
本文基于改进的非竞争型投入占用产出模型,提出了一个分析一国高技术产业国际分工地位的新框架,即通过编制区分高技术产业和传统产业的非竞争型投入占用产出表,计算"加权的增
论文旨在通过对实施知识产权尽职调查中容易忽视的法律问题进行分析研究,从实践层面的前期准备、权利调查、自由运作调查等环节展开论述,为知识产权尽职调查提供有益参考,有