新世纪我国高新技术产业的蓬勃发展，离不开54个国家级的高新技术产业开发区。我国高新区的发展越来越关系到我国技术产业的创新与国民经济发展，其意义十分重大。然而，目前在我国高新区的高新技术项目管理中，成本管理的意识、手段、技术非常欠缺，缺乏系统科学的管理方法和模式，直接制约着我国高新技术产业的发展壮大。因此，如何通过有效的成本控制来优化我国高新区高新技术项目成本管理职能，提高高新技术项目管理水平已经成为我国各个高新技术产业开发区面临的一个重大问题。本论文首先对项目成本管理，尤其是高新技术项目成本管理国内外的研究现状进行了分析，在此基础上对项目成本管理的相关理论进行了回顾。其次，深入剖析了我国高新区高新技术项目成本管理的现状及存在的问题。再次，研究了高新区高新技术项目成本管理模式，引入了全成本管理的理念，讨论了全成本管理的关键之处和计算方法。最后，在项目成本管理亟待变革的现状分析的基础上，设计了某高新区高新技术项目成本管理系统。采用本研究提出的基于全成本管理的高新区高新技术项目成本管理，能够在节约项目开展项目成本的同时，改变高新区项目管理的传统模式，由一次性的成本管理转向项目全流程的跟踪监控成本管理，由狭义的成本管理转向全成本管理，由项目承担单位独自管理转向高新区与高新技术项目承担单位共同参与的项目成本管理，由事后成本核算转向了项目实施过程中的全过程成本管理，使得高新区高新技术项目管理更加规范化、科学化、合理化、精细化。