企业管理信息系统中一个重要组成部分是会计信息系统，我国依据会计准则和理论方法在不同时期研究出的会计信息系统,深深地印上了各个阶段企业不同管理方法与体制的痕迹。随着全球经济一体化的迅猛发展，信息技术与财务技术的结合凸显其重要性。会计信息系统中的“辅助核算”功能近年来发展迅速，不仅具有多种核算类型还具有应用优势。财务人员要针对辅助核算的功能进行设计与应用，争取在企业核算管理和运营过程中，充分探究其功能并真正将管理与企业实务融合；企业可以根据自身经营特点对辅助核算进行多重交互的创新应用、进行现金流量表的编制与处理、运用往来核算功能对往来客商进行分析管理、自动进行成本结转等多项创新应用。但是在辅助核算的运行过程中还是存在缺陷，应该通过提供丰富的信息资料和分析功能、提供计划控制及分析功能以及提供多种预测分析功能，实现从辅助核算量变到辅助核算质变的过程。本文写作的主要目的是通过思考研究目前会计信息系统中辅助核算功能应用的缺陷和不足，结合企业未来管理信息化模式进行创新应用深度挖掘。通过一系列对辅助核算的优化设计，实现企业高品质绩效管理。同时针对创新应用中的短板进行设计多种分析功能—提供丰富资料分析功能、计划控制分析功能、多种预测分析功能等，是今后财务人员和研究人员工作的重点。本文总共分为七个章节：第一章是引言，主要介绍了会计信息系统中辅助核算的研究背景和意义，以及应用中的创新和不足之处。第二章系统的介绍了会计信息系统的涵义、组织结构和发展模式。第三章是会计信息系统中辅助核算的内涵及优势，列举了四项应用优势。第四章是会计信息系统中辅助核算应用的现实状况，目前辅助核算的应用存在很多缺陷，应用浅显、优势不足。第五章是基于辅助核算的会计信息系统优化研究，主要包括基于辅助核算进行多重交互创新性应用，对往来客商进行管理，汇编现金流量表，进行已销产品成本的自动处理等创新操作。第六章是从辅助核算的量变到辅助核算的质变，主要介绍多种分析功能的运用。第七章是结论，主要是对论文总体的描述及对未来发展前景的观望。