云南大理HIV阳性者感染弓形虫B1、GRA6、SAG3基因位点的研究

来源 :大理学院 | 被引量 : 3次 | 上传用户:xufuen2001
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1研究目的1.1初步了解云南大理HIV阳性者弓形虫感染情况。1.2探讨云南大理HIV阳性者感染弓形虫株B1、GRA6、SAG3基因位点,初步了解云南大理弓形虫基因型,为进一步的分子遗传学研究以及弓形虫病的防制提供资料。2研究方法2.1样本收集血液样本由云南大理白族自治州的艾滋病防治机构提供,经Western-blotting实验方法验证HIV阳性者的血液样本。2.2弓形虫IgM与IgG抗体的检测采用酶联免疫吸附法(ELISA)对HIV阳性者的血液样本进行弓形虫IgM与IgG抗体的检测,筛选弓形虫IgM与IgG抗体阳性的标本。2.3弓形虫基因提取选择弓形虫IgM与IgG抗体阳性的全血标本进行弓形虫基因提取。2.4基因扩增采用经两轮扩增的巢式PCR扩增技术。2.5基因回收、纯化选择B1、GRA6、SAG3基因扩增阳性的产物经琼脂糖凝胶电泳成像后,进行基因产物的回收和纯化。2.6基因的限制性内切酶酶切(RFLP)B1基因选择Pm1I与XhoI内切酶,GRA6基因选择MseI内切酶,SAG3基因选择NciI内切酶。将纯化后产物加入相应的限制性内切酶,消化16小时后,进行琼脂糖凝胶电泳成像。2.7基因的序列测定将巢式PCR技术扩增阳性的B1、GRA6、SAG3基因的产物纯化处理后,送基因公司进行序列测定。3结果3.1本次共检测317份血液样本,其中HIV阳性感染者的血液样本293份,正常对照人群样本24份。云南大理HIV阳性者弓形虫感染率为36.2%,其中弓形虫IgG抗体阳性97份,阳性率为33.1%;弓形虫IgM抗体阳性9份,阳性率为3.1%;健康体检者IgG抗体阳性率4.2%。3.2采用巢式PCR成功扩增出B1基因47份、GRA6基因29份、SAG3基因42份。用相应的限制性内切酶进行酶切,琼脂糖凝胶电泳后可见B1基因有500bp左右大小的条带,GRA6基因有600bp和200bp两条条带,SAG3基因有200bp左右大小的条带。3.3选择样本扩增阳性的弓形虫B1、GRA6、SAG3基因进行序列测定后,与Genbank上注册的弓形虫B1、GRA6、SAG3基因(注册号分别为AF17987.1、AJ635332.1、JX218225.1)序列进行对比,发现上述基因的碱基对之间存在少量的差异和缺失,并在弓形虫SAG3基因序列中的25bp处找到NciI酶切位点(CCGGG),弓形虫GRA6基因序列中的146bp和690bp处找到MseI酶切位点(TTAA)。4结论4.1云南大理HIV阳性者弓形虫感染率为36.2%,高于该地区正常人群弓形虫抗体阳性率。4.2采用巢式PCR成功从云南大理HIV阳性者弓形虫抗体阳性的全血标本中扩增出B1、GRA6、SAG3基因。4.3云南大理HIV阳性者感染的弓形虫B1、GRA6、SAG3基因酶切的凝胶电泳结果与弓形虫RH株相同,初步判断云南大理HIV阳性者感染的弓形虫基因型以基因I型为主。4.4云南大理HIV阳性者感染的弓形虫B1、GRA6、SAG3基因扩增阳性样本的测序结果显示,弓形虫B1、GRA6、SAG3基因与Genbank上注册的弓形虫RH株基因的碱基对之间仅存在少量的差异和缺失,初步判断云南大理HIV阳性弓形虫感染者基因型与弓形虫RH株一致。4.5云南大理HIV阳性者感染的弓形虫为基因I型,未见基因II型、基因III型和和其它基因型。
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