纵观当代世界,在全球化的多维特征中,一个引人注目的现象是,全球化趋势与区域化趋势相伴而生,相伴而行,强烈的区域化呼声始终伴随着经济全球化的进程。随着福建省委、省政府提出建设海峡西岸经济区的战略构想后,闽南区域经济一体化问题又一次突显出来。但是,这种一体化遇到了旧的行政体制的阻碍,出现了行政区经济、区域公共事务难以治理、区域政府间不良竞争等大量问题。本文认为,造成当代中国区域经济一体化难以快速推进的根本原因,不在于行政区划本身,而在于区域政府间科学合理的合作机制的缺失。因此,要真正解决这一问题,就必需从理论和实践上加以分析,从多中心治理和复合行政等角度,积极构建区域政府合作机制,实现跨地区公共产品的提供和跨地区公共事务的治理,从而达到区域经济一体化的战略目标。第一部分:区域经济一体化和政府合作问题的提出。从理论、现实基础及国内外实践经验分析入手,提出区域经济一体化和政府合作的必要性和必然性。第二部分:闽南区域经济一体化与政府合作存在的问题。回顾闽南区域经济一体化及政府合作的发展历程,提出了二者分别存在的一系列问题。第三部分:闽南区域经济一体化进程中政府合作机制构建。从推进闽南区域经济一体化具有重要的战略意义角度入手,提出应积极构建区域政府平等互信的政治对话机制、互惠互利的利益协调机制、科学规范的硬约束机制、快速高效的信息联通机制和合理有效的组织协调机制,建立新型的区域地方政府间关系,进而实现闽南区域经济一体化的战略目标。作者得出的结论是,闽南区域经济一体化必须要有与之相适应的区域政府合作机制,这既是现有体制下实现区域经济一体化的动力机制,也是区域经济一体化所必然产生的制度效应在我国政府管理体制上的体现。这种政府合作与市场推动的融合效应必将推动闽南地区真正走向一体化,最终为加快福建经济社会协调发展,实现建设海峡西岸经济区战略目标做出积极贡献。