合作社以为社员服务为宗旨，在世界范围内大受欢迎，多次在世界经济危机中取得良好业绩。在我国以家庭承包经营为基础、统分结合的双层经营体制下，农民专业合作社是对双层经营体制的完善和补充。自2007年7月1日第一部《中华人民共和国农民专业合作社法》实施以来，我国农民专业合作社取得迅猛发展。截止2013年底，全国农民专业合作社总数达88.4万个，社员4776万户，带动非社员6130万户。农民专业合作社已经成为建设现代农业、带动农民共同致富、农村社会管理的重要载体。但是，现阶段农民专业合作社普遍存在规模实力弱、产业链条短、盈利水平低、抵御风险能力差等问题。加之，农产品市场竞争愈加激烈，农产品质量安全问题更加突出，合作社原有的经营模式已经不能完全适应社会形势的新变化。农民专业合作社需要突破传统框架纵向一体化发展，通过扩大社员规模、拓展业务范围、延长产业链条，减少交易成本，提高合作社获利空间，增强其市场竞争力，更好发挥对农户的带动作用。实践亟需理论指导，但国内对农民专业合作社纵向一体化方面的研究不多，更缺少系统研究。本选题在当前显得尤为必要，具有很强的理论意义和实践意义。本文主要从以下几方面展开研究：第一，从国外和国内两个视角对合作社纵向一体化发展现状进行分析。第二，测度农民专业合作社纵向一体化水平。在课题组对陕西省15个县市区72家种植业农民专业合作社305户社员调研的基础上，利用层次分析法，选取农业产前、产中、产后三个环节的19个指标对样本合作社的纵向一体化水平进行测度，包括产前环节、产中环节及产后环节的一体化水平测度。第三，分析纵向一体化对合作社经济绩效影响。在已有研究的基础上将纵向一体化指标引入合作社经济绩效评价体系，构件两个计量模型利用二元Logitic方法，分析纵向一体化因素（包括产前、产中、产后一体化因素）及合作社治理特征、外部环境因素等对合作社经济绩效的影响。第四，农民专业合作社纵向一体化影响因素分析。在考察纵向一体化因素对农民专业合作社经济绩效影响的基础上，基于合作社组织的角度，从交易成本、农产品质量安全、本身特征及外部环境等方面，选取14个指标考察影响合作社纵向一体化的因素。利用Tobit计量方法，构建四个计量模型，对样本合作社的整体纵向一体化、产前环节一体化、产中环节一体化及产后环节一体化分别实证分析各因素的影响情况。第五，考察社员参与合作社纵向一体化经营活动的影响因素。基于社员角度，从社员个人及家庭特征、社员信息化特征、社员生产特征、社员入社特征、社员农产品安全生产意识、交易成本及村庄特征等方面选取18个指标，利用有序Probit计量模型考察各因素对社员参与合作社纵向一体化经营活动的影响情况。第六，农民专业合作社纵向一体化模式比较及边界讨论。基于调研情况，本文分不同产业总结出农民专业合作社六种纵向一体化典型模式，并采用案例分析的形式予以说明，从提高合作社绩效、降低交易成本、保障农产品质量安全等角度比较各种模式的优点和不足。给出合作社纵向一体化模式选择原则，并讨论了边界问题。通过研究，本文得出以下结论：第一，农民专业合作社总体的纵向一体化水平不高，但提高合作社经济绩效作用明显。第二，农民专业合作社内部管理不规范，不利于纵向一体化发展。第三，农民专业合作社没有建立起有效规避市场风险的体制机制。第四，理事长纵向拓展业务意识淡薄，合作社缺乏纵向一体化发展的长远规划。第五，社员对合作社的了解有助于其积极参与合作社开展的各项活动。第六，政府资金扶持有助于农民专业合作社的发展壮大，还需要进一步完善各级示范社的评定条件。第七，政府对农产品质量及食品安全监管有助于提升农民专业合作社纵向一体化水平，但仍需要加强对农业生产的产前、产中环节监管。第八，农业加工企业带动合作社业务范围的快速拓展，二者之间的利益联结关系需要规范完善。第九，农民专业合作社纵向一体化模式的选择，要综合考虑合作社所经营农产品的产销特性、合作社的自身条件等。