医药制造企业属于高新技术企业,具有明显的高投入、高风险和高回报特征,同时,医药制造企业紧密关系着大众的健康和生命安全,又具有很强的技术研发性质。我国的医药制造企业近几十年有了很大的发展,企业数量众多,产能也很大,医药制剂产能和化学原料药产量现已居世界第一。然而我国医药制药企业的发展主要还是通过众多企业低水平重复生产来实现的,企业的技术创新能力还比较弱,技术创新效率水平比较低,已经成为制约我国医药制造企业向更高水平发展的重要因素。随着经济全球化的不断加速和国际竞争的日趋激烈,跨国医药制造公司不断进入中国,我国本土医药制造企业将面临更大的压力。提高技术创新能力,提升技术创新效率已成为我国医药制造企业提高竞争力,获得可持续发展的重要途径。通过借鉴国内外有关技术创新效率评价和分析方法的研究,简要构建我国医药制造企业技术创新效率指标体系,运用DEA方法,以我国29个上市医药制造公司为样本,利用其2009年-2011年数据,得出企业的技术创新效率总体效率、纯技术效率和规模效率,了解我国医药制造企业技术创新效率状况。其次,在借鉴前人创新效率影响因素相关理论的基础上,进一步对影响我国医药制造企业技术创新效率的因素进行分析,提出了相关假设,并运用Tobit回归方程模型进行回归分析,得出医药制造企业技术创新效率的主要影响因素。最后,以重庆Q药业股份有限公司(以下简称Q药业公司)为例,根据评价结果和影响因素,结合其企业的具体情况,对Q药业公司技术创新效率进行分析,总结其在技术创新中值得借鉴的地方,以及在技术创新方面的一些问题和面临的风险,在管理、研发和生产方面提出相应策略和建议,以进一步提升Q药业公司技术创新效率。研究结果显示,通过医药制造企业技术评价结果,我国医药制造企业总体技术创新效率中等偏低,企业间技术创新效率差异比较大；通过实证分析得出影响技术创新的因素主要包括研发投入、人员素质、管理水平、销售效率、企业成长能力等；根据医药制造企业技术创新效率评价体系和主要因素分析,结合Q公司实际情况,我们可以得出,近些年来Q公司在技术创新方面取得的成绩主要是因为重视研发投入和研发创新工作,医药产品结构得到调整,及较为完善的创新一体化平台。而面临的风险在于管理水平还有待提高,人力资源素质较为偏低、生产成本较大等。Q药业公司应该积极开展管理创新工作,培养具有创新精神医药人才,加快新药研发及完善生产制造体系,以进一步提升其技术创新效率。