草莓EST-SSR引物的开发及四季草莓成花机理的初步研究

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草莓(Fragaria ananassa Duchesne)香气浓郁,酸甜宜人,倍受广大消费者的喜爱,是重要的经济果树。由于草莓品种繁多且表型相似,难以靠肉眼区分,加大了培育优质草莓的难度,需借助分子辅助手段对草莓品种进行鉴定。EST-SSR分子标记因其高重复性、易操作的特性深受国内外科研工作者的青睐,草莓EST-SSR引物也被陆续开发出来,但相较于其他果树而言,草莓的有效EST-SSR标记数量仍然偏少。因此本研究利用公共数据库公布的草莓EST序列搜索并筛选合适的SSR位点,设计并合成草莓EST-SSR引物,在分子遗传方面对25个草莓品种进行鉴定及区分。此外,草莓有一季草莓与四季草莓之分,研究草莓周年成花机制以促进草莓花芽分化具有较大的实际应用价值。故本研究以四季草莓‘蒙特瑞’和一季草莓‘章姬’为材料,比较不同生长发育阶段中两种草莓植株的碳氮比差异以及Fa LFY、Fa SOC1、Fa AP1、Fa FT、miR156和miR172基因的表达模式差异,以期初步探讨四季草莓的成花机制,为其他农作物培育四季品种提供理论依据。具体研究结果如下:1.从NCBI上搜索并下载59795条草莓EST序列,利用CD-Hi T在线剔除冗余序列,Seqman软件屏蔽载体序列,得到的24776条EST序列中2992条为SSR-EST序列,包含有3516个SSR,经统计分析,二核苷酸和三核苷酸重复是草莓EST-SSR的主要类型。基于特异性引物设计原则,设计并检测SSR-EST序列引物,发现多态性引物数占所设计引物总数的52.5%。2.挑选7对多态性引物作为核心引物用于25个草莓品种的分子鉴定,结果成功将它们完全区分开,并构建了它们的指纹图谱。3.通过测定可溶性糖与可溶性蛋白含量来比较不同生长发育阶段‘蒙特瑞’与‘章姬’碳氮比差异的变化,发现高C/N有利于四季草莓成花;而一季草莓‘章姬’即使出现高C/N阶段,也无成花信号出现。推测“碳氮比假说”仅适用于四季草莓。4.通过q PCR技术检测了Fa LFY、Fa AP1、Fa SOC1、Fa FT、miR156和miR172基因在‘蒙特瑞’和‘章姬’内的不同时期特异性表达,进行了差异表达比较分析。结果发现:(1)Fa LFY和Fa AP1基因的表达有相互促进作用,在‘蒙特瑞’中似有周期波动,这可能对‘蒙特瑞’草莓的周年成花具有重要作用;(2)Fa SOC1基因在‘蒙特瑞’和‘章姬’内表达趋势十分相似,而相较‘章姬’,‘蒙特瑞’的表达更趋于稳定,说明Fa SOC1或是调控四季草莓成花转变的重要基因;(3)Fa FT基因对Fa SOC1基因具有促进作用,在‘蒙特瑞’和‘章姬’内表达趋势稳定且相似,但‘蒙特瑞’中Fa FT基因表达量却更低,推测Fa FT基因对四季草莓成花的作用或受到多基因多途径调控,导致其表达丰度不显著;(4)miR156的表达在草莓中会随着苗龄的增长而下降,miR172则呈现相反的表达模式。另外,四季草莓‘蒙特瑞’在花瓣露出至花瓣开放阶段中的miRNA表达趋势与一季草莓‘章姬’及其他植物中miRNA的表达规律完全相反,期间其miR156表达上升而miR172表达下降,表明‘蒙特瑞’中具备特异的调控通路和网络。
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