近几年，在国家政策的扶持和引导下，我国科技型中小企业进入迅猛发展的时代，并已经成为促进经济转型和产业结构升级的重要力量。科技型中小企业是市场经济环境下中小企业中最具有生命力和发展前景的企业，是大型高新技术企业的起源和基础。但是在实际发展过程中，融资难问题成为限制科技型中小企业成长的主要瓶颈之一，专业性科技担保公司的出现则成为解决科技型中小企业融资难问题的有效措施；同时，传统担保行业已达到发展的瓶颈，科技担保公司也逐渐将成为推动我国担保行业转型升级的重要力量。在国家政策的有力支持下，近年来科技担保公司数量逐渐增加，但关于如何对其进行综合评价仍有许多问题需要进一步探讨。科技担保公司的发展离不开对自身的清晰检视、政府的政策支持以及合作机构的认可，但这些都需要依赖对科技担保公司进行有效的综合评价，但由于理念限制、政策缺失以及案例缺乏等原因，目前专门为科技担保公司设计的综合评价指标体系仍缺乏统一性和科学性。本文将从管理学的角度出发，从分析现有科技担保公司综合评价体系在实际运用过程中存在的问题入手，结合实际案例探析存在问题的成因及危害，同时从实际管理运用的角度出发，提出重构科技担保公司综合评价体系的设想和模型，并从实证角度以R科技担保公司作为案例进行分析和检验。本文研究的成果不仅可以满足不同地区对于科技担保公司综合评价体系的要求，还可以满足不同主体、包括科技担保公司自身对于综合评价体系的需求，在一定程度上弥补了国内对于该领域理论研究的空白，具有较强的实际运用意义。