随着我国信息化建设水平的逐步提高和高等教育事业的不断发展，新的《高等学校财务制度》、《高等学校会计制度》、《事业单位会计准则》和《行政事业单位内部控制规范》等一系列规章制度的颁布实施，要求高校的财务管理实现全面的预算管理、动态的资金管理、科学的预测分析和绩效考核，并对校园一卡通及数字化校园予以整合，通过对高校资源进行有效的管理、控制、配置和优化来确保国家财政资金的使用安全、有效。现在各高校的财务管理理念和使用的财务管理软件已经相对滞后，不能适应当前信息化和事业发展的需求。具体表现为高校的财务管理系统基本上以会计核算为主，各个管理模块（子系统）基本上毫不关联，相互独立，各模块间没有建立一个完整的沟通机制，只是解决了机械性的人工重复和简单的管理问题，没有深层次的管理理念和更高的信息化技术支持。整个财务管理的系统性较弱、关联性不强，对高校管理的支撑有限。建立全新的高校财务管理系统，构建持续可发展的高校财务管理框架，使各个方面的管理数据和财务管理信息形成及时、良好、通畅的互动机制，相互之间有一系列的勾稽关系和指标控制，为教学科研单位的管理、各相关部门的管理、财务管理、高校领导层和政府主管部门决策提供准确、及时、科学的理论依据；为高校财务管理系统开发商提供开发思路和技术路线。本文通过国家政策、信息化环境、高校财务管理现状、内部管理对高校财务管理系统的需求等方面进行研究，综合现有的研究和实践成果，对高校财务管理系统进行重新规划和设计，形成新的管理理念和系统理论。研究成果可拓宽财务管理思路，为高校领导者提供新的“大财务”的管理理念，使高等学校信息化建设和财务管理水平的提高相互促进，达到全面提升高校管理水平的目的，推动我国高等教育事业的发展。