FcRn作为猪初乳中IgG浓度候选基因的分析

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由于初乳性状的复杂性,长期以来该性状的研究不多,育种改进不大,且随着对猪生长性状的不断选择,初乳中IgG水平在群体中的状况也是未知的。由于初乳中IgG含量与仔猪的特殊关系,对该性状实施分子育种将成为一个很有前景的研究领域。本研究以猪FcRn(neonatal FcReceptor)的多态性为研究内容,分析该基因作为初乳中IgG含量候选基因的可能性。 以饲养在相同条件下的杜洛克(D)、长白(L)、大白(Y)三个品种207头母猪为研究对象,应用BAC克隆测序和PCR直接测序得到FcRn的核苷酸序列,通过ELISA测定猪初乳中IgG含量,然后用PCR-SSCP方法对该群体的207头母猪进行FcRn的SNP搜索。应用设计的7对引物进行PCR扩增,目的片段经SSCP分析显示:外显子3、内含子5、外显子6在群体中存在多态性。对有多态的位点进行克隆测序,结果发现:外显子3中的一处碱基由T→C,是同义突变;内含子5中的一处碱基由G→C;外显子6中的一处碱基由A→C,是错义突变,导致苏氨酸变成精氨酸。 采用SAS软件对猪初乳中IgG含量、仔猪3日龄窝平均增重与各多态位点的基因型进行关联分析,结果显示:在固定效应模型分析中,品种、仔猪平均初生个体重、外显子6处的突变对仔猪3日龄窝平均增重的影响差异显著(p<0.05);品种、胎次、内含子5处的突变、外显子6处的突变对初乳中IgG含量的影响差异显著(p<0.05);外显子3处的突变位点对这两个生产性状的影响差异不显著(p>0.05)。同时对生产性状影响差异显著突变位点的基因型用多重T检验的分析结果表明:CC型与CD、DD型的初乳中IgG含量差异显著(p<0.05);FF、EE、EF型的初乳中IgG含量差异显著(p<0.05),其中FF型与EE、EF型的初乳中IgG含量差异极显著(p<0.01),FF型与EE、EF型的仔猪3日龄窝平均增重差异显著(p<0.05),EF型与EE型的初乳中IgG含量差异显著(p<0.05),EF型比EE型的初乳中IgG含量高,EF型与EE型仔猪的3日龄窝平均增重差异显著(p<0.05),但EF型比EE型母仔猪的3日龄窝平均增重要低。 本研究的结果表明:FcRn是一个高度保守的基因,共发现了3处突变,只有内含子5、外显子6处的突变与生产性状有关联。外显子6处突变不同基因型的初乳中IgG含量、仔猪3日龄窝平均增重差异显著(p<0.05),内含子5突变不同基因型的初乳中IgG含量差异显著(p<0.05),仔猪3日龄窝平均增重差异不显著(p>0.05)。
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