随着我国经济的飞速发展,商业活动的不断扩展和翻新,税收规避已成为不容忽视问题,其存在严重影响了经济和法制建设,不仅造成国家的财政流失,更破坏了税法制度的公平性。实质课税原则是税法上的一个颇具争议的原则。对税收规避行为的治理是实质课税原则在税法实践中具有代表性的适用领域,通过强调在税法的解释和使用中透过形式追求实质,可以揭露纳税人在合法形式掩盖下规避税收的真实意图,维护税收公平和正义。将实质课税原则合法合理的引入反避税制度中来是税法学界普遍的共识,但在具体操作过程中还存在着诸多问题,通过近几年的税收制度改革和实践,实质课税原则在反避税中发挥了重要的作用,但仍有很多方面需要学者做更多的理论研究,更多的问题需要法制工作者不断完善和提高。积极探索实质课税原则在反避税法律制度运用中的理论与实践问题并促进其得到合理完善,是目前紧迫和关键的任务。笔者在国内外学者的研究成果之上,主要采用比较分析法、历史分析法和实证分析法等法学方法对针对反避税中应用实质课税原则的问题做以探讨。本文试图以实质课税原则的基础理论作为支撑,探讨在反避税法律制度中实质课税原则的运用所具有的理论及实践问题,并结合目前西方国家反避税的立法、执法、司法经验及我国的国情,对我国运用实质课税原则治理税收规避行为的相关法律制度提出完善建议。全文共分三部分：第一章是实质课税原则与税收规避治理。第一节是实质课税原则的概述,主要从含义、作用、和价值等方面介绍该原则。第二节是税收规避的概述,分析了税收规避行为的法律性质以及经济和法律上的影响。第三节是运用实质课税原则治理税收规避存在的问题。理论方面梳理了实质课税原则与税收法定主义间的关系,实践方面从立法、执法、司法角度分析了运用实质课税原则治理税收规避存在的问题。第二章是各国适用实质课税原则治理税收规避的状况考察。第一节是运用实质课税原则治理税收规避的模式比较。主要分析了美国、日本、德国以及英国的反避税中实质课税原则的应用状况。第二节是我国适用实质课税原则治理税收规避的现状分析。通过归纳梳理我国现有相关反避税立法,分析实质课税原则的适用状况,发现在立法、执法以及司法过程中存在的理论困境和实践上的难点。第三章是我国运用实质课税原则治理税收规避的完善。针对前文实证考察和比较分析,体现出我国在运用实质课税原则治理税收规避问题过程中的种种问题,提出建议和改进措施。第一节是提出在立法过程中针对不同立法模式所应该注意的问题。第二节以我国相关部门近年来发布的反避税文件和法规为框架,对反避税执法过程中的问题提出了解决方案。建议尽快推行和完善税收征管的听证和申辩制度,明确举证责任等。第三节建议在司法解释中适时地引入实质高于形式规则、一步交易原则等具有较高立法水平的规则概念,与国际反避税的制度发展状况接轨。