自进入20世纪以来，全球发生了众多耸人听闻的财务舞弊丑闻，上市公司治理结构缺陷也被人们所诟病。内部审计，作为治理结构的一块基石，起着改善公司治理效率的重要作用，自然受到众人关注。上市公司内部审计设置模式是指公司中内部审计部门的隶属层级设置情况。如果内部审计隶属层级越高，独立性和权威性越明显，越能从根本上解决管理层为了个人利益而进行的利润操纵。鉴于此，本文基于现代企业治理的背景下，借鉴国内外已有的研究成果，对首次公开募股即IPO公司内部审计设置模式如何影响公司财务报告质量这一问题进行了深入的探讨和研究。本文的研究路径是，是否设置内部审计部门，怎样设置内部审计部门，设置后的效果如何。因此本文首先从理论上对内部审计与公司治理的关系作了分析。同时本文对我国2007~2009年深交所IPO公司的内部审计设置模式作了统计，结果表明：第一，目前内部审计部门主要设置在董事会及其下设的审计委员会中，这说明我国上市公司已经开始意识到内部审计独具的内部治理功能，通过组织结构的设计来保障其独立地位。第二，本文从实证角度总结了当前IPO公司内部审计设置动机并得出了结论。第三，本文以2007~2009年深交所IPO公司的220家公司作为样本，采用真实盈余管理和深交所财务信息披露评级等指标共同衡量财务报告质量，研究内部审计设置模式是怎样影响财务信息质量的。结果表明二者呈现显著的正相关关系。内部审计部门隶属层级越高，财务信息质量越好，财务报告披露透明度越高。另外，本文也进行了稳健性检验，检验结果进一步支持了本文的研究结论。最后，本文从改善内部审计环境、保障内部审计设置模式、明确内部审计定位、提高内部审计人员执业能力等方面提出相关建议。