改革开放以来，军工科研事业单位为我国国防科技工业发展作出大量贡献的同时，对于国民经济发展也起到了积极作用，在我国社会主义现代化建设中处于重要地位。随着我国经济发展和社会进步，军工科研事业单位在国家宏观调控管理政策引导下，正在迎来更为崭新的发展前景。近年来，国家关于对事业单位实施分类改革的新政策逐步出台，事业单位的发展即将面临在保留公益职能或者转制企业的本质区别，军工科研事业单位因其担负的特殊使命和历史传统，与普通事业单位存在较大差别，因此，在国家分类改革形势下面临着更为严峻的考验，也凸显了军工科研事业单位在分类改革下的绩效与激励管理的重要性，在此研究背景下，本文针对国家军工科研事业单位在分类改革下的管理问题开展研究。本文从人力资源理论与发展现状、事业单位人力资源特性等方面开展具体研究，借鉴现代人力资源管理的学科研究基础和内容框架，以北京某航天研究院为实例，分析了以事业单位分类改革为背景下的事业单位人力资源管理特点，总结存在的主要问题，以及事业单位分类改革后人力资源绩效管理所面临的机遇与挑战。在此研究基础上对北京某航天研究院的人力资源绩效与激励管理工作提出了具体的改进措施建议，第一是要科学建设人才队伍体系，系统规划人才激励机制；第二是要完善绩效考核管理制度，加强考核结果运用及激励作用；第三是要建立规范合理的岗位薪酬体系，扩展多元化激励手段。分类改革背景下的军工科研院所当前人力资源绩效与激励管理的核心任务是建立“以人为本”的核心管理观念，摒弃掉计划经济时代传统的人事管理观念，建立完善的制度体系，结合组织战略目标一方面在强化人力资源绩效管理的基础上提升管理的水平，另一方面还需对激励手段、约束机制进行开发，充分调动员工的积极性，挖掘员工的创造潜力，充分发挥他们的潜能，在维持人力资本存量的前提下进一步开发人力资本，形成人力资本的有效保值增值。希望通过对该研究院的实证研究，能够为国内分类改革背景下的军工科研事业单位在转制过程中的绩效与激励管理工作提供一定的经验及材料。