基于DNA条形码的无齿蚌属物种有效性分析及其系统发育研究

来源 :南昌大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wudingyong2009
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淡水蚌类广泛分布于全球除南极以外的淡水水域中。由于其具有重要的经济意义、生态作用,以及独特的生活史,引起了极大的关注,具有重要的研究潜能。中国是世界淡水蚌类分布中心之一,尤其以长江中下游地区淡水蚌资源最为丰富。近年来,由于生境恶化,栖息地逐步减少,加之人类活动的干扰,淡水蚌的物种多样性在下降,北美已有70%的物种处于濒危或易危的地位,急需我们采取正确的保护措施。从保护生物学的角度来看,正确的物种分类是提出可行性保护策略的基础。传统的分类主要依据贝壳形态,但淡水蚌的壳很容易随环境发生改变,趋同进化也给物种鉴定带来了很大的困难,尤其无齿蚌属,分布广泛,遍布于整个北美、古北区,在东洋界的北部尤其丰富。表型可塑性强,壳形变化大,分类及其混乱,是贝类学家最感棘手的属之一。作者采集了江西及其周边水体大量无齿蚌属标本,采用ND1、COI和COII三个线粒体基因作为DNA条形码候选基因,分析三个线粒体基因的序列特征,比较其种内和种间的差异。用MP、ML、BI三种方法分别建立了系统发育树,并且结合NCBI中其它无齿蚌亚科的相关序列,分析无齿蚌属的系统发育,以期为无齿蚌属的分类提供分子证据。主要得出以下结论:(1)基于系统发育树的拓扑结构和DNA条形码的10倍法则,将所研究的12个无齿蚌属种合并为6个有效物种:无齿蚌Anodontawoodiana comb.nov.、椭圆无齿蚌Anodonta elliptica comb.nov.、蚶形无齿蚌Anodonta arcaeformis comb.nov.、光滑无齿蚌 Anodonta lucida、具角无齿蚌Anodonta angula、上饶无齿蚌Anodonta shangraoensis nov.;(2)发现无齿蚌属一新种Anodonta shangraoensis nov,种名来自采集地点江西上饶。该种群有7个个体,形态上与已确定的无齿蚌属种差异较大,系统发育树中单独聚为一支,且与其他种的种间差异较大,形态和分子证据均表明该物种为一新种;(3)三个分子标记构建的系统发育树表明,采自抚州金溪的2个未定名种A.sp8、A.sp9在系统发育树中与椭圆无齿蚌聚类在一起,且两者的种间遗传距离较小(0.003),被鉴定为椭圆背角无齿蚌;具角无齿蚌与椭圆背角无齿蚌合并为椭圆无齿蚌,蚶形无齿蚌、黄色蚶形无齿蚌、舟形无齿蚌、河无齿蚌、球形无齿蚌合并为蚶形无齿蚌;(4)ND1、COI和COII三个条形码候选基因均可作为无齿蚌属物种鉴定的条形码,能够有效鉴定无齿蚌属物种。但从扩增效果上来看,ND1基因优于COI、COII基因,且ND1基因比COI-COII基因的种间差异大,更适合用作无齿蚌属物种鉴定的DNA条形码。
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