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目的:为了深入研究绵羊MHC基因序列classⅠ区段中基因的结构,构建以美利奴羊五种内脏器官为材料的cDNA文库,并对该文库进行质量评定,以美利奴羊BAC文库中含有MHC片段的141C4号阳性克隆为材料通过酶切末端标记制备放射性探针,与已构建的cDNA文库进行原位杂交以筛选含有MHC classⅠ区段基因序列目的克隆,通过对目的克隆测序及生物信息学分析,研究141C4号克隆中基因的组成结构。
方法:⑴以美利奴羊五种内脏器官为材料构建cDNA文库,对文库中的阳性克隆进行酶切鉴定,对插入片段大于500bp的阳性克隆进行测序,测序结果经过软件Sequence Scanner V1.0去除冗余序列,处理后的序列在GenBank公共数据库中BlastX比对分析,获得的信息在KEGG数据库进行多肽功能分析;⑵对美利奴羊BAC文库141C4号克隆进行测序,将其酶切后通过末端标记制备成具有放射性的探针,通过噬菌斑原位杂交筛选构建好的cDNA文库,通过放射自显影获得目的克隆,通过对目的克隆测序及生物信息学分析,研究141C4号克隆中基因的组成结构。
结论:①对美利奴羊cDNA文库进行质量评定,库容文库的库容量约为3.28×105pfu,扩增后文库的滴度为4.405×108pfu/ml,选取随机克隆酶切电泳验证,重组98.4%,平均插入片段1.5kb,获得的数据表明该文库质量较高,随机挑取阳性克隆测序获得256个独立序列,通过对这些序列进行BlastX比对和KEGG功能分析,将其按照编码的蛋白质所执行的功能分类;②以美利奴羊BAC文库141C4号克隆为材料制备的放射性探针,通过噬菌斑原位杂交方法筛选cDNA文库,尚未获得杂交信号,此项工作尚在进行中。