编码白颖苔草热激转录因子基因的克隆及其序列分析

来源 :中国农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wcqadam
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高温及其他一些化学和生理胁迫能诱导机体产生热激蛋白。真核生物中热激因子调节热激基因的表达。植物热激转录因子可分为三类:HsfA、HsfB、HsfC。在非生物逆境,尤其是热逆境下,A类热激转录因子在调节热激蛋白的表达方面起着重要作用。在正常生长条件下,热激因子处于钝化的单体状态,热激时,热激因子形成三聚体并与热激原件(HSE)结合,从而激活热激蛋白基因的表达。此外,热激蛋白也对热激转录因子起负反馈调节作用。 本文比较了GenBank中已登录的多种植物热激转录因子的氨基酸序列和核苷酸序列,根据保守序列设计一对简并引物,通过RT-PCR从白颖苔草(Carex xigescens)中扩增出189bp cDNA片段,根据此片段序列设计3端特异引物,利用3RACE得到902bp的3端cDNA片段。根据3端片段序列设计5端特异引物,利用5RACE得到323bp的5端cDNA片段。通过序列拼接获得该基因的全长cDNA,序列分析其含有一个完整的开放阅读框(103bp-1023bp),编码的蛋白质含有306个氨基酸,分子量为38.75KDa,等电点为5.85。CrHsf的氨基酸序列与OsHSF的同源性为59%,与已知的其他热激转录因子也具有较高的同源性。在CrHsf的氨基酸序列中没有预测的信号肽以及跨膜区域,但是具有多种翻译后修饰的加工位点:1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、3个N端酰基化位点、2个N端糖基化位点、3个蛋白激酶C磷酸化位点和1个cAMP和cGMP依赖的蛋白激酶磷酸化位点。
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