串珠藻属属于红藻门，真红藻纲，串珠藻目，串珠藻科，是一个具有明显特征的自然类群。目前已报道的全部种类均生活在淡水中，作为串珠藻科的模式属，是串珠藻科中分布最广，种类最多的属。作为海陆演变过程中残留在淡水中的孑遗植物，对环境因子要求特殊，分布区域封闭，特有种多，对研究地球环境的变化及生物自身的演变具有较高的学术价值。 本文简要描述了串珠藻属的形态特征及生活史，以及在中国的区系分布，包括已记录的串珠藻属植物2亚属，7组，26种(含变种)。 回顾了串珠藻属的建立及其所含类群的研究历史，归纳了目前在串珠藻属系统发育与进化研究中常用的分子标记方法，其中包括核基因组的18S rDNA、26S rDNA和ITS序列，叶绿体基因组的rbcL序列，线粒体基因组的cox2-3序列，以及新兴的ISSR技术。结果表明，ITS序列多适用于种群分化及相近种间遗传分析，ISSR标记适用于种下分类群间及同一种群不同个体间基因多态性分析，cox2-3序列在一定程度上也可用于同一种群不同个体间的基因多态性分析，而18S rDNA与rbcL序列既可用于种间关系分析，又可用于更高水平分析的构建系统树。这些分子标记已被证明在研究串珠藻目系统地理、物种起源和散布机制方面有着广泛的应用前景。 本文以在国内采得9株串珠藻的叶绿体基因组rbcL序列，结合Genebank获得的21株串珠藻rbcL序列，通过最大简约法，最大似然法与邻接法建立了系统发育树，与形态学相结合探究串珠藻属的系统发育关系。 结果表明国内采得串珠藻分属串珠藻组与扭曲组进化分支上，与基于形态特征的分类结果相一致，各样本均与国外同种具有很高的序列相似性。串珠藻属轮节发育良好，果胞对称，果孢子体定形，是一个具有明显特征的类群，分子系统分析呈现多系起源的系统发育关系。 在各种系统树上，串珠藻组各物种并未聚在同一分支上，弧形串珠藻，洪洞串珠藻，长柄串珠藻与内卷串珠藻，博雷串珠藻形成姐妹群的关系，而采自不同国家的鸭形串珠藻未形成单一分支。胶串珠藻分支与串珠藻组其它物种形成两大分支，在各种系统树上，两分支自展支持率皆较低，结合多变的形态证据分析，基本可以断定串珠藻组是一个多系起源，演化进程较长的分类单位。 此外，MP，ML与NJ系统树都支持绿色组与扭曲组位于同一进化分支，位于进化树最基部的位置，但其单源关系的自展支持率普遍不高，而在Bayesian树中两组分别位于两个分支。其进化地位有待结合更多的标本进一步探讨。沼生组和刚毛组在不同的系统树中进化地位不同，但都支持沼生组与串珠藻组有较近的亲缘关系。 rbcL序列在1282bp的片段中含有366个简约信息位点，进化速率较慢，已被证明在串珠藻种间及更高水平分析中，是一个有效的分子标记。利用多个序列联合开展系统发育研究，将会更好地反映真实的系统发生史。