2013年，国务院最新下发了《生物产业发展规划》，里面指出到2020年要把生物产业发展成为国民经济支柱产业，这意味着生物制药行业迎来了其发展的黄金时代。但生物制药行业作为新型的朝阳产业，具有技术含量高、多学科综合等特点，生物医药产品在研发、生产、销售的过程中，面临着各种复杂的风险，其中以财务风险的危害最大，如果不及时加以防范，很可能引发其他方面的风险导致企业出现危机，甚至破产。我国生物制药企业主要存在财务风险危机意识淡薄、监测和防控风险能力较弱等问题，增强应对财务风险恶化的能力就成为生物制药企业获取长足发展必须解决的问题。因此，深入分析生物制药企业可能存在的财务风险，找出风险产生的原因和特征，构建适合的预警模型，对提高其应对风险的能力非常重要。所以本文主要选择了我国生物制药企业，根据其自身特点对其可能存在的潜在的财务风险分析和研究，构建我国生物制药企业财务风险预警的指标体系，用因子分析的方法建立预警模型，并划分出预警区间，建立针对我国生物制药企业的财务风险预警机制。本文针对生物制药企业的特殊行业性质，根据其发展现状，分析总结其财务风险形成的原因和特征，借鉴有关专家学者在财务风险分析方面的研究成果，运用因子分析法，借助SPSS统计软件构建生物制药企业财务风险控制模型。在实证研究时筛选了6大类财务指标，分别是盈利能力、偿债能力、现金流量、风险水平、成长能力、营运能力指标共20个比率，通过因子分析法提取公共因子并得出因子得分矩阵，根据因子得分建立控制函数，随后确定控制阈值及划分预警区间，并进行准确性检验，最终确定生物制药企业财务风险预警模型。最后，结合具体的企业运用建立的模型进行财务风险预警，以达到实际应用的目的。