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头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma, HNSCC)是临床上常见的头颈部恶性肿瘤,其中以咽部鳞状细胞癌(pharyngeal squamous cell carcinoma, PSCC),喉部鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma, LSCC)与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma, OSCC)最为常见。约占全身恶性肿瘤的5%～10% ,平均发病率约为l0～15/10万。据研究报道,近年来,此类恶性程度较高的肿瘤其发病率呈上升趋势。尽管医疗科技的高速发展,头颈部鳞状细胞癌的早期诊断技术得到不断提高,临床上晚期病例仍占50%左右。在过去20多年中,手术方法、放疗、化疗技术都得到了很大提高,但是头颈部鳞状细胞癌,特别是晚期患者的五年生存率并没有明显提高。比较基因组杂交(comparative genomic hybridization, CGH)是1992年Kallioniemi创立的基于荧光标记和分子生物学、细胞遗传学技术鉴定基因组DNA的获得、缺失和扩增,并且可以把这些遗传变异定位在正常的中期染色体上的一种技术,其基本原理是用不同的荧光染料分别标记正常基因组DNA和肿瘤细胞DNA,然后与正常人中期染色体杂交,通过检测染色体上两种荧光信号的相对强度比率,了解肿瘤组织DNA拷贝数的改变,并能同时在染色体上定位。该技术的主要特点是在一次实验中,用1张中期染色体涂片(metaphase spread),就能在全基因组范围内分析DNA拷贝数的不平衡改变,检测和定位DNA序列拷贝数的获得和缺失,以提供一个全基因组的扫描图。近年来,随着分子生物学技术的进步,比较基因组杂交技术也有了很大的发展,在了解人类基因组的组织结构、基因定位和遗传病的诊断等方面发挥着越来越重要的作用。本实验通过对72例头颈部鳞状细胞癌(其中有17例咽部鳞状细胞癌,23例喉部鳞状细胞癌与32例口腔鳞状细胞癌)的比较基因组杂交分析,发现HNSCC的主要DNA序列扩增区为3q,7q,8q, 9q,11q13,17q,22q,5p,7p与12p,在3p,9p,4q,13q和11q而表现为DNA序列缺失。其分支咽部鳞状细胞癌的主要DNA序列扩增区在3q,8q,5p,7q,17q与11q12-13,主要DNA序列缺失区在3p,9p13q,4q和11q14-25,喉部鳞状细胞癌的主要DNA序列扩增区在3q,8q,5p,7q,17q,7p与9q,主要DNA序列缺失区在3p和9p,口腔鳞状细胞癌在3q,8q,5p与11q12-13表现为DNA序列扩增,而在3p表现为DNA序列缺失。总体显示头颈部鳞状细胞癌的分支咽部鳞状细胞癌,喉部鳞状细胞癌和口腔鳞状细胞癌染色体变化有着显著的差异(p<0.05 )。本实验通过CGH研究HNSCC染色体变化的基本规律,为临床分子诊断提供一定的依据,为更深入探讨染色体主要变化区域可能包含的癌基因或抑癌基以及揭示HNSCC发病机理,对其分支的差异分析为肿瘤分型提供一定基础。