在信息与创新交融的时代,国家高新区是我国自主创新能力提升的重要载体,是我国在世界创新之林的闪亮名片,也是全球创新系统的核心组件。在肯定国家高新区20多年来辉煌成绩的同时,应注意到高新区创新系统的运行质量是否与其总量规模同步提升,是否与其预期目标和功能定位相匹配,是否满足.创新资源配置效率最优化的客观要求等突出问题。目前,国内外学者将关注点集中在该领域的方法创新和视角深挖方面,忽视了对高新区创新系统框架结构、运行质量和系统优化等整体性研究,致使理论框架模糊、实践指导性偏弱。因此,本文力图从创新系统运行质量的新视角,评价与分析国家高新区的系统架构、相对水平、差异特征和运行漏洞,以期获得对国家高新区创新系统运行质量提升具有借鉴意义的思路和建议。全文分为六部分,共七章。第一部分为引言部分,重点介绍了本文的研究目的与意义、国内外研究现状以及研究内容与方法。第二部分为理论基础研究,从战略基点、地域范围、功能定位、系统运转四个方面,界定国家高新区创新系统的基本概念,归纳出多样性、客观性、整体性、动态性、自组织性、战略性等系统特征,并分析了国家高新区创新系统“四三结构”及其运行机理。第三部分为指标选择与模型构建,综合运用鉴别力分析和相关性分析对理论遴选指标进行双重实证筛选,对最终确定的44个评价指标及其数据来源依次进行详细说明,并构建了基于“投入-主体-产出”的高新区创新系统运行质量灰色关联评价模型。第四部分为运行质量测算与差异特征分析,包括第四章和第五章的内容,根据国家高新区各阶段的时空发展状况和现状特征,选取56个国家高新区作为灰色关联分析对象,并采用层次聚类法得到“金字塔式”五层聚类分布,即先导示范层、跨越逼近层、突破增长层、支撑带动层、后发追赶层。同时,国家高新区创新系统运行质量在空间布局、城市依托、结构均衡性等方面呈显著差异特征。第五部分为提升战略重点,基于运行质量提升的战略指导思想和基本原则,结合园区现有薄弱环节和发展瓶颈,提出了运行质量提升的五大战略重点,即三螺旋互动协作战略、科技经费使用提效战略、创新人才开发培育战略、服务支撑平台配套战略、创新文化氛围营造战略。第六部分为全文总结、创新点归纳和研究展望。