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萝卜是我国的一种重要的蔬菜，我国萝卜种质资源十分丰富。开展萝卜种质资源遗传多样性的研究，有利于萝卜种质资源的收集、保存、鉴定、创新和有效利用。分子标记能直接从DNA水平反映各材料间的遗传差异，是研究生物遗传多样性的有力工具。RAPD标记和AFLP标记具有简单、快速和无种属特异性的优点，被广泛地用于遗传多样性和种质分类研究。本研究采用了形态标记、RAPD标记和AFLP标记，结合系统聚类分析、主成分分析和主坐标分析，对56份萝卜种质资源的遗传多样性和亲缘关系进行了研究。主要结果如下： 1．对萝卜10个形态性状进行了鉴定和分析，其平均多样性指数为0.80。利用形态标记将56份种质分为5个组。主成分分析表明，利用形态性状对萝卜分类时，首先考虑的是颜色，其次是根的性状，最后是叶的性状。 2．筛选出12个随机引物，对56份萝卜种质进行了RAPD分析，共扩增出109条带，其中多态性带数为72条，多态性百分率为62.9％，平均期望杂合度为0.289。系统聚类分析将56份种质分为7个组，主坐标分析将其分为3个大组，两种分类方法的结果基本一致。 3．筛选出了8对引物，对56份萝卜种质进行了AFLP分析，共扩增出327条带，多态性带为128条，多态性百分率为38.1％，平均期望杂合度为0.362，系统聚类分析将供试材料分为9个组，主坐标分析将其分为4个大组，两种分类方法结果基本一致。 4．将RAPD标记和AFLP标记的结果整合在一起，对56份萝卜种质的遗传多样性进行了研究。系统聚类分析将供试材料分为9个组，主坐标分析将其分为4个组，两种分类方法结果基本一致。 5．对形态标记和分子标记之间的相关性进行了Mantel检验。形态标记和分子标记之间的相关系数范围为0.230～0.255，RAPD和AFLP标记之间的相关系数为0.662。 6．比较了RAPD标记、AFLP标记对56份萝卜种质遗传多样性的研究结果，RAPD标记的多态性百分率比AFLP标记高，但平均期望杂合度较低，两种标记都适用于对萝卜种质资源遗传多样性的研究。在本研究中，两种标记对56份萝卜种质的聚类表现出了高度的相似性。 7．综合分析本研究的结果，可将56份萝卜种质分为以下7组：Fekete、役者横丁、心里美萝卜、国光等各自单独聚为一组，来自欧洲的9份种质聚为一组，来自韩国的种质聚为一组，国内种质聚为一组。国内种质的分类表现出了与根皮色密切相关的特征，基本上是根皮色为红色的聚为一个亚组，根皮色为白色和绿白色的聚为一个亚组。