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后套木嘎遗址位于吉林省大安市,2011~2014年吉林大学边疆考古研究中心和吉林省文物考古研究所联合对后套木嘎遗址进行了大规模的考古发掘,初步构建了嫩江流域新石器时代早期至汉代的考古学文化的编年与序列。该遗址出土遗存大致可以分为七期,其中第三期是“后套木嘎第三期类型”遗存,年代为距今6500—5600年左右;第四期属于哈民忙哈文化遗存,年代为距今5500-5000年,相当于红山文化晚期。本文选取了第三、第四两期出土的34例古代牛样本,对其进行了分子考古学研究,主要内容分为以下几点:第一,对34例古代牛样本进行前期处理、打磨、抽提、PCR等实验操作,成功从中提取出24例mt DNA序列。整个实验过程严格按照古DNA实验流程操作,尽可能杜绝一切外源污染和样本交叉污染,以保证得到的古DNA序列真实有效。第二,根据变异位点将24例序列分为9个单倍型:BP1-BP9,对其进行BLAST共享序列搜索、系统发育分析和遗传距离计算的结果显示,后套木噶第四期的HT31样本属于家养黄牛中的T3世系,这是我国东北地区目前发现最早的家养黄牛,距今5000年左右。其余23例古代牛为原始牛中的C世系,现代家养黄牛中未发现C世系存在,表明这一世系可能并没有被人类驯化,其母系遗传对现代黄牛没有基因贡献。第三,将古DNA结果与后套木嘎遗址中出土的动物骨骼沟的研究情况结合分析,表明当时自然环境优越、野生动物资源丰富、人类捕猎技术十分成熟,因而肉食资源十分丰富,正因如此后套木嘎古代野牛未被驯化。第四,后套木嘎遗址第四期遗址中发现距今5000年左右的家养黄牛,与西北地区发现的最早家养黄牛时间相近,这暗示黄牛可能通过两条路线进入中国,一条是通过新疆-河西走廊向东传播,另一条是经由欧亚草原-东北亚,传入我国北方地区。