疫病是外感疫疠邪气所引起的具有强烈传染性易引起大流行的一类急性发热性疾病的统称；是中国古代对人民的健康与生命摧残最甚的一类疾病。近年来,人们逐步认识到人类与疫病的斗争将会继续下去,防疫事业尚有漫长的路程。古疫情调查及其流行病学研究,以及古疫情与中医相关理论方治的综合研究,对于中医和现代医学及其他相关学科的研究工作有着不可低估的潜在价值。本文对明清闽南疫情文献资料作系统全面的调查与整理分析,结合疫病种类及其时空分布、相关的自然环境和社会背景,探讨明清闽南疫病流行的特点和规律。对明清闽南地区的防治疫病情况进行分析,将与疫病流行相关的各种社会现象作出阐述,以此体现疫病流行对闽南地区人类社会生活所产生的深远影响。明清时期闽南地区疫病的流行情况从现有资料来看有如下特点：疫病流行清代较明代频繁；疫病流行时间多发生于夏季；漳、泉、厦三地流行次数分布较均；疫病种类多,其中以鼠疫的发生频次最多；自然灾害及社会事件可以引发或加重疫病的流行；疫病的流行影响闽南地区的社会活动并产生互动。本文通过对所收集整理的相关文献进行分析研究,总结出明清时期闽南地区疫病发生和流行的一些规律,并就明清闽南疫病与社会之互动作出宏观评述,一方面填补明清闽南地区疫病文献研究方面的空白,同时对前人小范围的古代疫病调查分析方法进行补充和完善,另外为今天的防疫工作提供参考和借鉴。