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ApoE是一种阿朴质蛋白(apolipoprotein),它有299个氨基酸。它可以同LDL受体蛋白、肝素以及磷酯相结合,其主要的生理功能是调节体内磷酯的代谢。它同第三类高酯血、动脉硬化及老年痴呆病相关。了解apoE的结构以及其在体内的分子生物学过程,可提高人类对这些疾病的预防以及治疗的水平。ApoE氨基端(1-199)的结构已用X-Ray法进行了测定,而apoE羧酸端及整个分子的结构依然未知。由于apoE蛋白质分子量较大,NMR信号重叠较多,不利于结构的解析以及片段相互作用的研究。我们拟利用INTEIN媒介蛋白质拼接方法,制备部分同位素标记的apoE ,降低NMR结构解析的难度。受体相关蛋白(Receptor-associated protein, RAP)是一种LDL受体折叠的伴侣蛋白,它由323个氨基酸组成,同apoE一样,可以同LDL受体蛋白结合,两者之间有一定的相似性。本文着重研究了利用INTEIN媒介蛋白质拼接法制备apoE,并对RAP及各片段性质进行了初步的研究。在使用蛋白质拼接法制备部分同位素标记apoE的过程中,详细研究了相关蛋白的制备及拼接反应的条件,产物的纯化。在制备羧酸端的过程中,使用三种不同的方法:直接法制备,使用CNBr切断法以及凝血因子Xa酶切方法,经比较发现凝血因子Xa酶切法无论时收率还是稳定性方面均较成功,但该方法的缺点是存在非特异性的酶切位点;在对apoE氨基端研究过程中,发现使用碱性的培养介质可提高蛋白质的表达收率,使用简单含巯基的化合物进行硫醇解后所得产物会发生水解,无法用于下步的反应;在比较了不同的蛋白质拼接方法后,发现使用INTEIN媒介的蛋白质拼接法可以得到较好的效果;使用优化后的反应条件,第一次大量地制备了部分片段同位素标记的apoE,并进行了NMR测定,得到了简化了的NMR谱图。为进一步使用NMR研究apoE的结构提供了可能。本方法对于制备其它部分同位素标记的蛋白质有借鉴意义。针对在使用pTYB1表达载体表达蛋白质的过程中出现的自裂解现象,进行了比较分析,有针对性提出的解决方案。所得到的两种变异体可以部分或几乎完全禁阻自裂解。所使用的方法具有通用性,完全可应于其它的蛋白质的表达过程。使用蛋白质交联反应,脂结合能力测定及CD等手段,对RAP及其片段的热力学性质进行了初步研究。