科学有效的治理模式是新时代开发区发挥治理优势、提高经济绩效的制度性保障。历经30余年的发展,由于资源禀赋条件、发展生命周期、功能定位的不同,我国开发区在治理中因地因时制宜地形成了多元化的治理模式。从开发区的核心治理行动者与政府在治理中嵌入程度的不同出发,可以将开发区的治理模式划分为政府主导型、政企合作型与企业主导型。根据管委会职能的不同,政府主导型治理模式又可以进一步划分为管委会全治型、管委会主治型与管委会协调型。根据政企两者间紧密程度的不同,政企合作型治理模式可以划分为政企合一型、政企模糊型与政企分离型。从历史制度主义的视角来看,我国开发区的治理模式存在着从企业主导走向政府主导,从派出机构走向一级政府,从政企统合逐步走向政企分离的演化规律。开发区承担的功能更为复杂与价值更加多元化,开发区与周边政府的协调与变化,产城融合需求等共同促进开发区的治理主体需从经济组织转为行政组织,以替代经济组织在行政职能和资源统筹协调上的缺陷,为开发区的发展和治理从制度上提供保障。区域融合协调发展的需求,开发区内生性转型发展变化,及其对土地等核心资源的渴求等促使其治理模式从派出机构走向一级政府。市场经济体制转轨与外部宏观制度环境的变化,政府职能与理念的转变,企业主体自主性的增强等共同促进了治理模式从政企统合走向政企分离。总的来说,我国开发区治理模式的初始制度设计具有多样性、其演化过程具有渐进性、演化动力具有双重性与演化方向上同异构并存。