随着知识经济浪潮的滚滚而来，BPR理论在国外教育组织中运用，促使国内的学者及研究型管理者对一切建立在传统职能化教育模式之上的各种各样的管理方法进行深刻反省，我国的一些教育工作者和行政管理人员也开始研究流程再造理论在我国教育组织中的应用问题。现阶段无论是高校的管理还是教学都受到信息时代潜移默化的影响，高校传统的管理模式以及教学模式势必都会随着知识、科技的不断更新而改变，“高校去行政化”的提出，更是要求高校要加大力度改革现有的模式及流程。因此，笔者认为高校教学管理部门亟待运用现代管理理念和方法，通过识别和分析传统教务管理业务流程中存在的问题，对低效的流程进行优化和改进，从而使高校教务管理实现管理科学、服务高效、师生满意的目标。本文试从企业先进管理模式业务流程再造（BPR）入手，分析昌吉学院管理现状，剖析原因，改造现有流程，主要得出以下结论：1.分析现有高校管理情况，提出高校教学管理模式必须要适应时代发展，改革的核心就是流程再造。2.通过业务流程再造理论的指导，明确提出昌吉学院教务管理流程优化的目标一是转变管理观念，由管理转向服务；二是提高办事效率，由“集权管理”转向“分权管理”，权利下移；三是极大限度地简化流程；四是以项目化思维整合工作任务；五是建立网上综合教学管理流程的技术平台，实现业务流程管理自动化。3.打破现有工作界定和科室工作界限，以昌吉学院教学质量监控为例，用项目思维构建教学质量监控实施办法，把教学质量监控分为五个项目：学院顶层设计项目、人才培养方案管理项目、日常教学管理项目、教学质量监测项目、教学质量分析和改进项目。教学质量的监测是由信息收集模块、信息反馈模块、教学评价模块三个模块的实施来进行监测。4.通过分析昌吉学院的教务管理流程，保障其再造顺利进行，需要做到几下几个方面：一是创新教务管理理念进一步提高学校管理效能；二是建立文件化的流程管理制度调配教学资源、维护教学秩序，保障教学质量；三是做好教务管理队伍建设规划，进一步优化师资队伍数量和结构，加大高层次人才引进和培养的力度；四是加强教学管理，不断提高教育教学质量；五是构建完善的教务管理信息技术平台。业务流程再造理论在高校的应用研究还处于探索阶段，本文在高校教务管理流程优化方面作了一些探索和尝试，力图为高校的教务管理改革提供一种新的思路和的方法。