我国地缘辽阔，区域经济发展呈现出很大的不均衡，并且金融发展在我国也呈现出地区差异的特征。同属西部的新疆和内蒙古他们的经济发展差距就十分明显，而促进区域经济的和谐发展是中国政府所关注的重要问题。随着金融对经济的影响程度的加深，很多学者都纷纷研究金融发展和经济发展的关系，金融效率也是影响经济增长的因素之一，很多研究表明金融效率的提高有助于经济效率的提高。而新疆和内蒙古同属西部地区，经济增长差距在扩大，两区的金融效率对经济增长是否有影响，以及影响差异多大有待进一步证明。本文从新疆和内蒙古两个地区入手，从金融效率因素的角度，着重研究金融效率对经济增长的影响。首先，本文在阐述了金融发展理论和区域经济增长理论的基础上，采用新疆和内蒙古1998年至2010年的数据，对比新疆和内蒙古的金融效率整体水平及经济发展现状，对金融效率对区域经济增长影响差异进行了初步判断，然后，采用灰主成分法对新疆和内蒙古的金融效率进行了综合评价和回归分析法实证分析新疆和内蒙古金融效率对经济增长影响的差异，并对结果进行了比较分析，经过比较找出新疆金融效率和经济增长落后于内蒙古的原因，最后，针对新疆的实际情况提出对策建议来促进新疆经济的发展。研究表明，新疆和内蒙古金融效率是存在差异的，新疆的综合金融效率除了2000年以外其他年份都落后于内蒙古。而且，由实证结果可知新疆和内蒙古金融效率对区域经济增长的影响是显著的，并且不同区域的金融效率对经济增长的影响程度也不一样，内蒙古的金融效率对经济增长的贡献力度更大，差距还是比较明显的。并且，新疆和内蒙古储蓄动员效率、储蓄向投资的转化效率以及投资投向效率对经济增长的影响都存在差异。因此，我们可以从金融效率的角度从储蓄动员效率、储蓄投资转化效率以及投资投向效率三个方面提出对策建议，促进经济增长，实现区域经济的和谐发展。