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目的 比较抗酸染色与PCR-荧光探针法检测在福尔马林固定、石蜡包埋组织中结核分枝杆菌(Mycobaeterium tuberculosis,MTB)检测的应用.方法 收集西京医院2018年1月至2019年10月共543例疑似结核患者,所有组织标本均经10％中性福尔马林固定,常规石蜡包埋、切片,HE染色,行抗酸染色及PCR-荧光探针法检测.结果 543例疑似结核患者的石蜡包埋组织中,抗酸法检测MTB阳性58例,阳性率为10.68％,PCR-荧光探针法检测MTB阳性211例,阳性率为38.86％,两者阳性率比较差异有统计学意义(P<0.05),两种方法符合率为69.98％.其中明确临床诊断结果者187例,PCR-荧光探针法Youden指数(J=0.5245)较抗酸染色法Youden指数(J=0.2095)高.结论 PCR-荧光探针法检测石蜡包埋组织中的结核分枝杆菌,阳性检出率显著高于抗酸染色法,且诊断价值高,能够为临床提供可靠的诊断依据.