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蛋白质β-发夹模体片断的识别
蛋白质β-发夹模体片断的识别
来源 :内蒙古工业大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sakurabb1
【摘 要】
:
依据β-发夹氨基酸序列中的保守性特征,分别以氨基酸(20种氨基酸和一个空位)和氨基酸紧邻关联为参数,通过构建位置权重矩阵和选取氨基酸最佳序列模式片断,利用相似性打分函数,对蛋
【作 者】
:
姜雪
胡秀珍
【机 构】
:
内蒙古工业大学理学院,沈阳工业大学辽阳校区基础部
【出 处】
:
内蒙古工业大学学报:自然科学版
【发表日期】
:
2008年2期
【关键词】
:
Β-发夹模体
位置权重矩阵
相似性打分函数
域值
β-hairpin motif
position weight matrix
similarity sco
【基金项目】
:
内蒙古自然科学基金资助项目200508010509
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依据β-发夹氨基酸序列中的保守性特征,分别以氨基酸(20种氨基酸和一个空位)和氨基酸紧邻关联为参数,通过构建位置权重矩阵和选取氨基酸最佳序列模式片断,利用相似性打分函数,对蛋白质超二级结构β-发夹模体片断进行识别,获得了较好的预测效果。
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