【摘 要】
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利用黔北麻羊、贵州黑山羊和贵州白山羊构建DNA池,设计1对引物扩增其STAT5A基因第10外显子及部分内含子序列。PCR产物纯化后进行双向测序。DNAStar和BLAST分析确定多态性位点
【机 构】
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贵州大学动物科学学院; 贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室; 贵州省畜牧技术推广站;
【基金项目】
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贵州省重大科技专项计划(编号:黔科合重大专项字[2011]6009号);黔西南州种草养羊产业发展省州科技合作专项(编号:黔西南科合字[2011]5-3号);贵州大学研究生创新基金(编号:研农2014012)
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利用黔北麻羊、贵州黑山羊和贵州白山羊构建DNA池,设计1对引物扩增其STAT5A基因第10外显子及部分内含子序列。PCR产物纯化后进行双向测序。DNAStar和BLAST分析确定多态性位点。利用生物信息学软件分析SNPs位点对STAT5A基因RNA二级结构、STAT5A蛋白二级及三级结构的影响。结果表明:在扩增的STAT5A基因中筛选到3个SNPs:C-32A、G+71A和G+158A,其中G+71A为错义突变,导致编码的丙氨酸(Ala)变为苏氨酸(Thr);C-32A和G+158A均在内含子区,不参与氨基酸编码。SNPs位点对STAT5A基因RNA二级结构和STAT5A蛋白结构均有一定影响。
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